140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1186 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  100 
 
 		 512 aa  1052    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  29.51 
 
 		 485 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  27.97 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  27.23 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.74 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  27.29 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  25.62 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 666 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  26.65 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  25.82 
 
 		 686 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  25.92 
 
 		 496 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.81 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  23.97 
 
 		 680 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  24.52 
 
 		 484 aa  97.1  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  24.72 
 
 		 694 aa  91.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.04 
 
 		 672 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  23.8 
 
 		 702 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  23.43 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  25.17 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  23.42 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  40 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  21.89 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  25.15 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  23.13 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  22.36 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.06 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.74 
 
 		 1005 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  24.22 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  24.3 
 
 		 1031 aa  64.3  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  22.51 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  21.31 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  25.71 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  21.12 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  22.8 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0846  amidohydrolase  32.5 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.01 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  35.71 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  37.21 
 
 		 1052 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25.17 
 
 		 1059 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  22.82 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  21.71 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  24.68 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  45.26 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.21 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  34.31 
 
 		 432 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  27.86 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  37.35 
 
 		 1062 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.51 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  21 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  21.67 
 
 		 435 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  22.31 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  34.12 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  25.31 
 
 		 437 aa  53.9  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  23.37 
 
 		 543 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  29.69 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  34.12 
 
 		 1066 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  19.87 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  30.08 
 
 		 1084 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.13 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0963  amidohydrolase  29.41 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  20.21 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  20.21 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  32.94 
 
 		 1062 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  24.4 
 
 		 1014 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  32.94 
 
 		 1062 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  32.95 
 
 		 1069 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  29.9 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  27.34 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  24.78 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  31.76 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  25.53 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  28 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  32.94 
 
 		 1065 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  24.24 
 
 		 425 aa  50.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  31.76 
 
 		 598 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  23.04 
 
 		 409 aa  50.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  31.76 
 
 		 1062 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.33 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  31.76 
 
 		 1062 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  31.76 
 
 		 1049 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  24.48 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  31.76 
 
 		 1062 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  31.76 
 
 		 1060 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  24.48 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  24.48 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.45 
 
 		 434 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  24.11 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  22.27 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  30.59 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  30.59 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  25.51 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  25.18 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  24.83 
 
 		 417 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  24.83 
 
 		 417 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  24.83 
 
 		 417 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  25.68 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  22.92 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.61 
 
 		 408 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>