204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0618 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  100 
 
 
496 aa  999    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  28.88 
 
 
490 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  26.89 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  29.11 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  28.07 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  29.18 
 
 
440 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  28.28 
 
 
485 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  27.03 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  30.7 
 
 
702 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  29.36 
 
 
470 aa  113  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  25.92 
 
 
512 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  26.13 
 
 
672 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  30.79 
 
 
511 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  25.86 
 
 
666 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  26.3 
 
 
680 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  23.68 
 
 
694 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.78 
 
 
1069 aa  97.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  23.91 
 
 
1066 aa  97.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  28.74 
 
 
438 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.4 
 
 
1081 aa  96.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.29 
 
 
1084 aa  96.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  23.92 
 
 
1062 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  23.92 
 
 
1062 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  23.82 
 
 
1049 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  27.2 
 
 
686 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  23.49 
 
 
598 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.49 
 
 
1062 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  23.99 
 
 
1067 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  23.06 
 
 
1062 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  23.77 
 
 
1062 aa  88.6  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  23.71 
 
 
1062 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.54 
 
 
483 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.06 
 
 
1062 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  23.28 
 
 
1062 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  22.94 
 
 
1060 aa  87  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  23.98 
 
 
1052 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  23.49 
 
 
1065 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  24.66 
 
 
692 aa  83.2  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.39 
 
 
1138 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.41 
 
 
1113 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.22 
 
 
1062 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  22.32 
 
 
1111 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  26.9 
 
 
543 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  29.73 
 
 
585 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.69 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  27.3 
 
 
1059 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  25.39 
 
 
540 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  27.12 
 
 
1042 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.61 
 
 
1071 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  29.14 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.38 
 
 
1042 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  27 
 
 
1040 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  40.22 
 
 
1078 aa  67  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.33 
 
 
1005 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  21.79 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  24.83 
 
 
1014 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  20.87 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  23.11 
 
 
409 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  33.5 
 
 
448 aa  63.9  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.68 
 
 
433 aa  63.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  34.34 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  27.4 
 
 
1031 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  37.5 
 
 
438 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  24.08 
 
 
1010 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  25.62 
 
 
529 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  35.71 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.84 
 
 
430 aa  60.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  38.95 
 
 
568 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.29 
 
 
426 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  31.13 
 
 
397 aa  60.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  23.59 
 
 
443 aa  60.1  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  27.41 
 
 
477 aa  60.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  24.42 
 
 
413 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  24.42 
 
 
413 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  42.73 
 
 
351 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  23.99 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  24.22 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  31.45 
 
 
426 aa  58.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  35.35 
 
 
440 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  40.78 
 
 
438 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  35.71 
 
 
455 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.91 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  23.61 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  40 
 
 
445 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  24.62 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  35.85 
 
 
819 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  33 
 
 
426 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  24.47 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  23.18 
 
 
409 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  36.72 
 
 
418 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  22.86 
 
 
414 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  33.68 
 
 
401 aa  53.9  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  38.78 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  38.78 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  38.78 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  37.88 
 
 
461 aa  53.5  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.78 
 
 
435 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.96 
 
 
445 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  41.33 
 
 
1020 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  37.76 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>