217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5309 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  100 
 
 
543 aa  1128    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  54.27 
 
 
540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  52.61 
 
 
529 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  27.77 
 
 
470 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  25.36 
 
 
686 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.85 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  24.68 
 
 
568 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  25.55 
 
 
666 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  24.84 
 
 
680 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  26.21 
 
 
511 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  25.31 
 
 
478 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  23.47 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  27.73 
 
 
490 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  24.68 
 
 
692 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.41 
 
 
672 aa  88.2  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  24.95 
 
 
485 aa  87.4  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.65 
 
 
1005 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  22.73 
 
 
438 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  25 
 
 
694 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  21.61 
 
 
585 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  26.46 
 
 
702 aa  83.6  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.81 
 
 
1084 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  23.65 
 
 
1138 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  25.06 
 
 
1052 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  24.95 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  22.94 
 
 
1111 aa  77.8  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  27.65 
 
 
496 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  22.69 
 
 
433 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  24.4 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  22.32 
 
 
1062 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.7 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  36.84 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  23.87 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  24.47 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  22.32 
 
 
1062 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.8 
 
 
1062 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  21.75 
 
 
440 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  38.24 
 
 
1113 aa  67  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  24.65 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  22.63 
 
 
1071 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  31.93 
 
 
1067 aa  64.3  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  36.73 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  30.22 
 
 
1062 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  31.09 
 
 
1062 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  29.76 
 
 
407 aa  62.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.47 
 
 
407 aa  61.6  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  23.53 
 
 
480 aa  61.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  31.09 
 
 
1062 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  37.74 
 
 
433 aa  61.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.98 
 
 
407 aa  60.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.19 
 
 
409 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.19 
 
 
409 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  30.25 
 
 
598 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  21.33 
 
 
493 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  37.04 
 
 
1059 aa  60.1  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.19 
 
 
409 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.62 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  30.25 
 
 
1062 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  30.25 
 
 
1062 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  40.96 
 
 
415 aa  60.1  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  30.17 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  28.57 
 
 
1049 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  22.07 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  42.68 
 
 
448 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  35.71 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  30.33 
 
 
1060 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  35.71 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  26.03 
 
 
403 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  31.5 
 
 
1014 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  23.18 
 
 
413 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  28.57 
 
 
1062 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  22.65 
 
 
412 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0166  amidohydrolase  35.79 
 
 
418 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  34.57 
 
 
444 aa  58.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  32.35 
 
 
1081 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  34.82 
 
 
1010 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  22.5 
 
 
413 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  30.52 
 
 
416 aa  57  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  50 
 
 
819 aa  57  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  29.41 
 
 
1065 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  32.35 
 
 
1069 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  23.01 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  31.37 
 
 
1066 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  40.96 
 
 
391 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.1 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  40 
 
 
444 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  32.43 
 
 
431 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  33.96 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  24.82 
 
 
438 aa  55.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  23.47 
 
 
512 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  33.33 
 
 
469 aa  54.3  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  34.57 
 
 
407 aa  54.3  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  29.27 
 
 
410 aa  54.3  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  26.84 
 
 
438 aa  54.3  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  32.67 
 
 
397 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  37.66 
 
 
441 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.45 
 
 
455 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  35.71 
 
 
445 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  27.61 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  48 
 
 
413 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>