272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1229 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  75.49 
 
 		 443 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  100 
 
 		 423 aa  875    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  99.76 
 
 		 423 aa  870    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  72.33 
 
 		 446 aa  643    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  43.94 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  38.78 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0166  amidohydrolase  38.21 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6839  amidohydrolase  35.11 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00614522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  35.82 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  31.48 
 
 		 447 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.58 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  30.5 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29.92 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  32.23 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.16 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.07 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.76 
 
 		 411 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.92 
 
 		 412 aa  156  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.57 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  29.15 
 
 		 450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  29.19 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  30.71 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  31.16 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.87 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  30.32 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.99 
 
 		 408 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.99 
 
 		 408 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.99 
 
 		 408 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.13 
 
 		 445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  28.21 
 
 		 441 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.54 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.12 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.96 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  30.08 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.27 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.64 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.97 
 
 		 419 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.06 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.38 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.79 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  28.12 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  28.65 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  29.23 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  31.08 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  28.16 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  28.16 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.06 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  29.95 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  30.38 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  29.88 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  29.21 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  30.32 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.16 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.44 
 
 		 455 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.22 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.05 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  27.85 
 
 		 406 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  29.31 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  29.31 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  29.73 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  29.31 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  29.7 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.13 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  33.23 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  29.13 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  29.71 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  29.13 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  29.64 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  29.13 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.87 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  27.94 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.23 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.28 
 
 		 421 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.2 
 
 		 451 aa  122  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  25.93 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  29.23 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  27.19 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.74 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  28.13 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  28.27 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  28.3 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  28.85 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.85 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  25.37 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.92 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  26.59 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  29.38 
 
 		 423 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  26.82 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27.23 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  27.74 
 
 		 470 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  27.91 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  25.55 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  25.43 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  25.75 
 
 		 486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  26.43 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  27.94 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  26.64 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.9 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  28.07 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  27.75 
 
 		 425 aa  114  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>