238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6839 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6839  amidohydrolase  100 
 
 		 437 aa  879    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00614522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  35.5 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  37.18 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  35.32 
 
 		 423 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  35.73 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  35.07 
 
 		 423 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  36.15 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  31.33 
 
 		 428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  33.17 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0166  amidohydrolase  33.52 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  31.75 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.93 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.21 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.16 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  30.71 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  29.28 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.75 
 
 		 407 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.41 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.2 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  27.27 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  30.9 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  28.01 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.15 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  30.32 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  27.59 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.57 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29.47 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  30.77 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  27.41 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  28.5 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.94 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  27.98 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  29.15 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  28.68 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  27.1 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.06 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.46 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  26.68 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  28.76 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  26.46 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  27.34 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  29.8 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  27.38 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  29.08 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  28.4 
 
 		 486 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  26.95 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.22 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.93 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  28.39 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  26.97 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  27.85 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.95 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  26.9 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.95 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.95 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.57 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  30.12 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.43 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  30.12 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  30.12 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  26.47 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  29.74 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  25.81 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  29.55 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  27.3 
 
 		 470 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  24.88 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  26.7 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  24.31 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  25.4 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.34 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  24.43 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  27.74 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  28.77 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  26.97 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.35 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  26.1 
 
 		 405 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  28.14 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  28.01 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  28.27 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  27.51 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  25.53 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  27.32 
 
 		 450 aa  98.2  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.62 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  29.06 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  29.83 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.17 
 
 		 455 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  28.81 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  28.1 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 		 443 aa  96.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27 
 
 		 417 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  23.57 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  24.23 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  28.11 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  29.93 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  29.35 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  27.18 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  29.22 
 
 		 393 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  27.62 
 
 		 447 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  28.88 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>