More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0331 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  100 
 
 
448 aa  900    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  43.19 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.37 
 
 
407 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.54 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.26 
 
 
444 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  30.77 
 
 
430 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  34.43 
 
 
433 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  34.86 
 
 
426 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.87 
 
 
445 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  32.08 
 
 
401 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  29.51 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.12 
 
 
430 aa  170  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.9 
 
 
433 aa  169  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.2 
 
 
444 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.33 
 
 
407 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  33.18 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.4 
 
 
455 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.36 
 
 
413 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.71 
 
 
405 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  30.58 
 
 
407 aa  159  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  29.76 
 
 
441 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  34.26 
 
 
391 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  30.83 
 
 
434 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.33 
 
 
431 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  31.8 
 
 
440 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  29.98 
 
 
444 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 
493 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.59 
 
 
407 aa  150  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  30.77 
 
 
437 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  32.9 
 
 
433 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  31.54 
 
 
428 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.77 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.34 
 
 
426 aa  146  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  30.94 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  31.91 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  29.54 
 
 
426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  29.89 
 
 
410 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  32.56 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.25 
 
 
459 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  30.52 
 
 
415 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  30.33 
 
 
422 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  30.1 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  28.69 
 
 
421 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.42 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  29 
 
 
470 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.12 
 
 
408 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31.12 
 
 
408 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.12 
 
 
408 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  29.73 
 
 
423 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.55 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  29.73 
 
 
423 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  30.36 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  29.81 
 
 
432 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  30.95 
 
 
411 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  27.79 
 
 
416 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  31.59 
 
 
423 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  29.81 
 
 
390 aa  124  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.13 
 
 
423 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.78 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  30.56 
 
 
403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  29.77 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.57 
 
 
666 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  28.57 
 
 
419 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  27.85 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  29.4 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  29.49 
 
 
490 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 
443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  26.48 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  28.13 
 
 
436 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  28.25 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  28.15 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  27.48 
 
 
456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  30.87 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  28.51 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  28.86 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  27.18 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.03 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  29.57 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  27.72 
 
 
413 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  27.32 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  27.44 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.49 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  27.11 
 
 
413 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  28.27 
 
 
432 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  27.66 
 
 
411 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  28.23 
 
 
402 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  27.44 
 
 
413 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  28.76 
 
 
446 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  28.32 
 
 
418 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  26.98 
 
 
390 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.08 
 
 
421 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27.17 
 
 
417 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  26.08 
 
 
450 aa  109  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  26.32 
 
 
461 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  26.57 
 
 
420 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  28.05 
 
 
417 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  28.05 
 
 
417 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  25.83 
 
 
444 aa  109  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>