275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0594 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  100 
 
 		 480 aa  964    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  52.61 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  38.6 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  36 
 
 		 435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  31.32 
 
 		 568 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.82 
 
 		 438 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.7 
 
 		 407 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  30.8 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  29.4 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.79 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  27.43 
 
 		 585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.34 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  32.47 
 
 		 397 aa  113  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.29 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.2 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  25.65 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.91 
 
 		 426 aa  106  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.06 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  30.84 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27.19 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.37 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  26.11 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  28.84 
 
 		 686 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  27.89 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.82 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.36 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.63 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.63 
 
 		 483 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  26.93 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  27.88 
 
 		 415 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.16 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  27.33 
 
 		 409 aa  96.7  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  29.18 
 
 		 419 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  27.37 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.41 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  26.37 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  27.02 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  26.08 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  27.17 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  29.09 
 
 		 409 aa  91.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  25.54 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.53 
 
 		 430 aa  90.9  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.06 
 
 		 432 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.91 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.25 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  25.06 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  27.44 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.77 
 
 		 426 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  28.2 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  28.2 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  28.2 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.37 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.37 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.37 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  25.38 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  25.99 
 
 		 423 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  30.23 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.63 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  25.99 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  24.94 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  25.8 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25.34 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.11 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.04 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  27.67 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  28.22 
 
 		 819 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  29.89 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  27.19 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  25.11 
 
 		 672 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  26.51 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  25.7 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  25.68 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  28.75 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  24.51 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  27.44 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  26.98 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  27.27 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  28.18 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  27 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.36 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.24 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.78 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  26.96 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  23.88 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.17 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.7 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  26.44 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  26.44 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  26.44 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  29.27 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.14 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  25.43 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.47 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  26.74 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  27.48 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  25.28 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  25.65 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  25.78 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  24.75 
 
 		 702 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  27.45 
 
 		 692 aa  70.1  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>