217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5667 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  100 
 
 		 529 aa  1099    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  65.04 
 
 		 540 aa  698    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  52.61 
 
 		 543 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  26.01 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1084 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  22.76 
 
 		 568 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  27.43 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  24.74 
 
 		 433 aa  90.5  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  24.88 
 
 		 470 aa  87  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.52 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  24.04 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  24.33 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  23.25 
 
 		 686 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  24.94 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  23.45 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.08 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  22.93 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  25.39 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  30.62 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  50 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  25 
 
 		 692 aa  72  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  23.94 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.95 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  23.55 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  21.49 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  24.4 
 
 		 1062 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  22.48 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  22.66 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  22.76 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.39 
 
 		 1014 aa  67  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  26.49 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  22.89 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  35.71 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  24.67 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  42.67 
 
 		 666 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  33.82 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  23.6 
 
 		 1138 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  23.31 
 
 		 680 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  22.18 
 
 		 432 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  26.17 
 
 		 819 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  23.02 
 
 		 1010 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  25.62 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  22.47 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  20.6 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  23.17 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  39.56 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  35.05 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.64 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  26.2 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  21.52 
 
 		 1060 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  38.82 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  23.15 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  36.46 
 
 		 1005 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  22.71 
 
 		 1052 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  22.82 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  23.53 
 
 		 1062 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  22.74 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  22.65 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0166  amidohydrolase  36.19 
 
 		 418 aa  57  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.53 
 
 		 1062 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.91 
 
 		 1031 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  38.64 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.53 
 
 		 1062 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  24.18 
 
 		 598 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  23.54 
 
 		 1081 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  39.36 
 
 		 391 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.01 
 
 		 434 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  41.03 
 
 		 1059 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  34.13 
 
 		 581 aa  54.7  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.22 
 
 		 1069 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  23 
 
 		 411 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  37.76 
 
 		 405 aa  54.7  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  32.77 
 
 		 587 aa  54.3  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  24.9 
 
 		 406 aa  53.9  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  38.54 
 
 		 413 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  24.1 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  31.9 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  43.21 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  22.77 
 
 		 1062 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  36.28 
 
 		 577 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  24.34 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  27.48 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  31.94 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  39.51 
 
 		 702 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  22.69 
 
 		 1062 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  24.13 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  55.56 
 
 		 400 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  24.86 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  23.29 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  21.27 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  35.83 
 
 		 556 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  32.98 
 
 		 1113 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  34.44 
 
 		 413 aa  51.2  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  22.58 
 
 		 426 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  39.76 
 
 		 351 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  38.2 
 
 		 423 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  38.2 
 
 		 423 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  35.05 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  31.11 
 
 		 413 aa  50.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>