More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2801 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  100 
 
 		 585 aa  1212    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  42.93 
 
 		 568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  28.6 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  27.12 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  27.67 
 
 		 435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.12 
 
 		 445 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  27.35 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.87 
 
 		 426 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.05 
 
 		 407 aa  114  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  25.05 
 
 		 441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  27.31 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  27.67 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  25.61 
 
 		 426 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.01 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  26.95 
 
 		 485 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  27.14 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.24 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.03 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 666 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.13 
 
 		 433 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  22.51 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  25.05 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  22.95 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  24.22 
 
 		 438 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.34 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.67 
 
 		 433 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  23.11 
 
 		 686 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.19 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  25.11 
 
 		 401 aa  98.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.78 
 
 		 444 aa  96.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  25.17 
 
 		 396 aa  95.9  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  25.87 
 
 		 421 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.01 
 
 		 437 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  24.54 
 
 		 433 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  24.77 
 
 		 390 aa  94.4  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.11 
 
 		 459 aa  94.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.98 
 
 		 428 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.95 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  24.75 
 
 		 470 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  24.72 
 
 		 1084 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.51 
 
 		 426 aa  90.5  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  23.23 
 
 		 451 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.31 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  21.66 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.76 
 
 		 672 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  23.14 
 
 		 431 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  23.08 
 
 		 490 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  24.73 
 
 		 1062 aa  88.2  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.84 
 
 		 400 aa  88.2  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  23.83 
 
 		 426 aa  87.8  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  24.12 
 
 		 819 aa  87.8  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24.95 
 
 		 1138 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  24.31 
 
 		 455 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.99 
 
 		 407 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  26.19 
 
 		 428 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  22.41 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  24.88 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  24.52 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  21.61 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  25.7 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  24.12 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  23.77 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3515  hypothetical protein  38.05 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.65 
 
 		 1005 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.62 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  22.39 
 
 		 1062 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  23.73 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  23.73 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  24.51 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  23.13 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  23.27 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.74 
 
 		 1014 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  22.98 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  25.88 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  26.37 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  22.44 
 
 		 1069 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  24.73 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0993  hypothetical protein  36.27 
 
 		 133 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  22.59 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  26.37 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  26.37 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  22.78 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  23.92 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  22.4 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.61 
 
 		 1071 aa  77.8  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  23.28 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  24.46 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  23.34 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.24 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1026  hypothetical protein  36.54 
 
 		 149 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  23.38 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  22.51 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  26.65 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  21.98 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  21.9 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  22.15 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  22.29 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  26.65 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  21.78 
 
 		 1081 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.98 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>