More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0028 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  78.75 
 
 		 1062 aa  1772    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  76.48 
 
 		 445 aa  714    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  61.81 
 
 		 1071 aa  1379    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  78.71 
 
 		 1049 aa  1759    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  78.89 
 
 		 1062 aa  1774    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  79 
 
 		 1067 aa  1774    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  46.23 
 
 		 1084 aa  988    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  49.26 
 
 		 1111 aa  1074    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  77.44 
 
 		 1081 aa  1766    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  75.82 
 
 		 1065 aa  1722    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  78.56 
 
 		 1062 aa  1770    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  81.56 
 
 		 598 aa  1041    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  76.52 
 
 		 1069 aa  1761    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  44.91 
 
 		 1078 aa  982    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  52.23 
 
 		 1138 aa  1142    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  76.57 
 
 		 1066 aa  1742    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  49.39 
 
 		 1113 aa  1060    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  77.95 
 
 		 1062 aa  1766    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  77.77 
 
 		 1062 aa  1763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  78.56 
 
 		 1062 aa  1769    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  76.5 
 
 		 1060 aa  1741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  45.78 
 
 		 1062 aa  1021    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  77.77 
 
 		 1062 aa  1765    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  100 
 
 		 1062 aa  2196    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  29.11 
 
 		 1052 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.6 
 
 		 1005 aa  237  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1042 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.48 
 
 		 1040 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.4 
 
 		 1042 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.81 
 
 		 1059 aa  218  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.16 
 
 		 1014 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  25.54 
 
 		 1010 aa  207  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  23.48 
 
 		 1031 aa  178  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.1 
 
 		 1097 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 666 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  27.09 
 
 		 470 aa  97.8  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  26 
 
 		 1090 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.4 
 
 		 1082 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.22 
 
 		 672 aa  95.9  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.35 
 
 		 1067 aa  95.9  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.29 
 
 		 440 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  26.4 
 
 		 415 aa  91.7  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.51 
 
 		 433 aa  91.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  24.88 
 
 		 694 aa  90.9  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  23.77 
 
 		 496 aa  89  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  24.26 
 
 		 1084 aa  84.7  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  22.39 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  25.25 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  23.8 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.4 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  25 
 
 		 435 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  22.38 
 
 		 478 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.44 
 
 		 362 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.12 
 
 		 717 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.02 
 
 		 976 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 403 aa  80.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.49 
 
 		 1125 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  25.58 
 
 		 819 aa  79.7  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.31 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.26 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.12 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  30.6 
 
 		 432 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.59 
 
 		 436 aa  77.4  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  31.07 
 
 		 427 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.84 
 
 		 430 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  26.29 
 
 		 1193 aa  77.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.24 
 
 		 590 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  21.24 
 
 		 1075 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.29 
 
 		 427 aa  76.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.4 
 
 		 428 aa  77  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  36.08 
 
 		 509 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.75 
 
 		 407 aa  76.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  30.36 
 
 		 428 aa  76.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  24.49 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  25.63 
 
 		 477 aa  76.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  33.92 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.95 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  37.18 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  32.91 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  23.95 
 
 		 1076 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.09 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  22.14 
 
 		 1167 aa  75.1  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  27.53 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  27.53 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  25.61 
 
 		 674 aa  74.7  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  27.53 
 
 		 431 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 441 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  24.28 
 
 		 426 aa  73.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 446 aa  73.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  25.48 
 
 		 419 aa  74.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  27.53 
 
 		 431 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.37 
 
 		 434 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.03 
 
 		 670 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.26 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.13 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 642 aa  72  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  22.54 
 
 		 426 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.04 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>