244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3066 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  100 
 
 		 490 aa  1004    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  33.12 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  30.43 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  31.48 
 
 		 511 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  29.85 
 
 		 451 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  28.06 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  30.05 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  28.83 
 
 		 686 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  27.89 
 
 		 680 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 666 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  28.88 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  27.17 
 
 		 694 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  28.82 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  30.56 
 
 		 702 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  29.24 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  25.5 
 
 		 819 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  26.65 
 
 		 512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  26.77 
 
 		 1084 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  29.67 
 
 		 478 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.54 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  27.29 
 
 		 692 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.16 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  26.11 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.43 
 
 		 430 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  27.21 
 
 		 568 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.9 
 
 		 470 aa  101  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.05 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  25.41 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.34 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.48 
 
 		 426 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  25.05 
 
 		 459 aa  97.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.06 
 
 		 672 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  24.69 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.34 
 
 		 1005 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  27.61 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.09 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.24 
 
 		 585 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  26.45 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  25.46 
 
 		 422 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.19 
 
 		 426 aa  87.8  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  27.39 
 
 		 413 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  24.58 
 
 		 423 aa  86.7  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.68 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  26.67 
 
 		 543 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  26.52 
 
 		 456 aa  86.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  27.94 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  27.17 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.55 
 
 		 1059 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  26.12 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  25.21 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.57 
 
 		 423 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.53 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.33 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  24.78 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.71 
 
 		 1042 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  27.23 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.3 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24.9 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.71 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  43.86 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  24.74 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  23.33 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  25.89 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  25.29 
 
 		 1031 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  24.64 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.27 
 
 		 1040 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  24.52 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  25.05 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  25.05 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  25.05 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  24.95 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  25.66 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.71 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  25.87 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  25.15 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.61 
 
 		 407 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  25.81 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  32.06 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  24.62 
 
 		 1010 aa  72  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  33.15 
 
 		 1052 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  24.28 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  24.49 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  25 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  24.27 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1042 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  25.87 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  25.78 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  22.86 
 
 		 1113 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  25.74 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  25.16 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  35.11 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  21.77 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  24.38 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  22.75 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  25.83 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  28.99 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  25.99 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.06 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>