255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2208 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  100 
 
 		 440 aa  899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  42.39 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  34.73 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.66 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.56 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.25 
 
 		 424 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  30.75 
 
 		 455 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  32.44 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.55 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.05 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30.89 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  31.52 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.52 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.39 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.39 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31.39 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.32 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.83 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  29.81 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  29.81 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  29.81 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.48 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.62 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.95 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  29.02 
 
 		 426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.95 
 
 		 432 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.23 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  29.59 
 
 		 405 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  30.1 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.11 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.79 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.11 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.78 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.32 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.1 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.96 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.54 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.25 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  27.74 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.71 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.27 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  29.86 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.91 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  27 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.65 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.09 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  29.09 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  28.38 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.15 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.46 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.74 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  27.27 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  27.25 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.87 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.13 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  28.46 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.66 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  29.2 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  26.12 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  27.93 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  28.32 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  27.05 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  28.03 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  30.89 
 
 		 413 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  26.83 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.29 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  27.87 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  25.8 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  28.47 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  25.77 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.12 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  25.3 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  28.54 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.85 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  26.14 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.73 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  31.59 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  26.97 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  24.31 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  27.3 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  27.97 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  25.91 
 
 		 447 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  26.91 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  28.5 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  27.3 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  26.85 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  26.63 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  27.3 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  26.44 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  27.11 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.94 
 
 		 451 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  25.77 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  25.47 
 
 		 442 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  29.07 
 
 		 445 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.89 
 
 		 483 aa  93.2  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  24.76 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  26.67 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  29.01 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  25.9 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>