More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1275 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  100 
 
 		 415 aa  862    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  78.31 
 
 		 415 aa  701    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.71 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.5 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.51 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  31.31 
 
 		 432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.95 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  29.2 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29.9 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.71 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.06 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.19 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  28.43 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.26 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.3 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.45 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.18 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  29.3 
 
 		 419 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.78 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.12 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.33 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.08 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.88 
 
 		 437 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.43 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  27.67 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  28.95 
 
 		 426 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.47 
 
 		 423 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  28.26 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.33 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.05 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.96 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  28.74 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  28.53 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.09 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.79 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  28.64 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  26.85 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  26.68 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.92 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  27.95 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  27.47 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  27.95 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  29.33 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  28.53 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.23 
 
 		 440 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  27.42 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  28.54 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  28.07 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  26.68 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.47 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.04 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.04 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.07 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.13 
 
 		 436 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  28.4 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27.78 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  23.4 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  28.83 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  27.43 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  28.11 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  28.6 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  27.93 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.78 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  26.98 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  29.51 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.43 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.13 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  27.55 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  26.98 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.32 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  27.57 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  28.28 
 
 		 456 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  29.62 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  26.9 
 
 		 408 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  27.03 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  27.57 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  27.44 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  28.43 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  27.76 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  28.13 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  25.12 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  27.45 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  27.11 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  26.16 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  27.43 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  28.61 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  28.51 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.85 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.71 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  26.51 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  27.6 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  26.51 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  26.51 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.14 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  26.57 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  26.23 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.32 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.91 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>