More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0747 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  100 
 
 		 444 aa  905    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  70.07 
 
 		 442 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  63.87 
 
 		 440 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  63.72 
 
 		 449 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  58.1 
 
 		 440 aa  511  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  53.67 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  52.67 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  43.54 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  37.59 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.84 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  37.11 
 
 		 457 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  41.62 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  39.48 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  34.89 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  40.48 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.44 
 
 		 407 aa  250  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  38.28 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  39 
 
 		 445 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  32.26 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.78 
 
 		 434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  32.11 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  31.78 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  30.96 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  32.41 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  31.76 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.69 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  31.95 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  32.64 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.09 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  30.64 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  30.09 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.5 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  30.28 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  31.01 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  29.79 
 
 		 441 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  31.23 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  30.9 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  30.9 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  31.61 
 
 		 451 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.62 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  30.23 
 
 		 450 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  30.99 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  33.16 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.09 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.63 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  31.9 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  31.09 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  29.58 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30.63 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.69 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  30.72 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  32.73 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  31.07 
 
 		 427 aa  169  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  30.2 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  31.97 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  30.2 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.38 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  30.18 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.22 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  30.86 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30.33 
 
 		 421 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.22 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.63 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.57 
 
 		 415 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  27.27 
 
 		 463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.23 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  30.61 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  28.53 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  29.25 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.53 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  29.38 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  29.94 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  30.52 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  29.66 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  30.23 
 
 		 449 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  29.52 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  33.89 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.09 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  30.98 
 
 		 408 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>