More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0750 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 441 aa  905    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  66.44 
 
 		 444 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  52.67 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  52.15 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  51.38 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  50.11 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  51.4 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  42.54 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  33.95 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.8 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  34.42 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.87 
 
 		 430 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.96 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.4 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.36 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.36 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.91 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  30.52 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  35.08 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  31.6 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  31.87 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  33.72 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.94 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  27.94 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  29 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  27.3 
 
 		 437 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.68 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  26.98 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  26.88 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  32.13 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  26.88 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  28.15 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  27.04 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  29.76 
 
 		 446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.51 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.65 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  32.37 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.36 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.54 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.2 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.21 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 444 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  29.12 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  27.78 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  26.23 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.46 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.02 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.02 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  26.23 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  26.35 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  27.99 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  28.08 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  27.56 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  27.86 
 
 		 435 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  26.5 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  27.1 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28.35 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  27.31 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.36 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.07 
 
 		 415 aa  156  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  26.51 
 
 		 449 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.17 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.82 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  26.05 
 
 		 474 aa  153  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  24.69 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  29.08 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  26.21 
 
 		 442 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  26.21 
 
 		 442 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  26.21 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  25.49 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  26.7 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  25.49 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  26.65 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  25.73 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  26.34 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  30.3 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26.15 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.02 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  24.67 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  25.75 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  25.74 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  24.53 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  25.71 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  25.62 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>