More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2397 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 352 aa  714    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  33.96 
 
 		 567 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.11 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.46 
 
 		 572 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  30.77 
 
 		 427 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  26.67 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.53 
 
 		 407 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.18 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  32.64 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.62 
 
 		 442 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.6 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.39 
 
 		 443 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  27.49 
 
 		 428 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.58 
 
 		 429 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.87 
 
 		 430 aa  93.2  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 642 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.73 
 
 		 442 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  27.15 
 
 		 450 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  36.31 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.58 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  29.53 
 
 		 444 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  30.57 
 
 		 450 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  29.53 
 
 		 449 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 450 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.02 
 
 		 448 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.1 
 
 		 446 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 462 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  29.53 
 
 		 449 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.95 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  26.42 
 
 		 449 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  30.41 
 
 		 439 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  30.94 
 
 		 443 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 436 aa  86.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  30.94 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  30.94 
 
 		 443 aa  86.3  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  37.33 
 
 		 415 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  25.65 
 
 		 457 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  27.97 
 
 		 435 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  30.87 
 
 		 430 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.69 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  24.91 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.31 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  34.18 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.85 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.72 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.72 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.18 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  31.72 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.63 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  28.74 
 
 		 1005 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.57 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.7 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  24.28 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.7 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  32.93 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  29.87 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  27.17 
 
 		 717 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  32.14 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  32.14 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  32.14 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.26 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  33.59 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  29.01 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.87 
 
 		 660 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  27.94 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  27.75 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  34.72 
 
 		 437 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.28 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.02 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  29.39 
 
 		 1040 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.08 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1042 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.74 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  29.01 
 
 		 1042 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.77 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.93 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  29 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  29.61 
 
 		 1097 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  29 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  28.14 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  28.14 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  25.52 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  27.63 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  27.53 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  43.75 
 
 		 620 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.56 
 
 		 432 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.05 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  25.88 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  34.38 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  36.92 
 
 		 629 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  28.14 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.64 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  31.18 
 
 		 1014 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  27.64 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>