More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4905 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  97.38 
 
 		 381 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  100 
 
 		 381 aa  740    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  43.42 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  36 
 
 		 432 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  43.9 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  31.44 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  34.04 
 
 		 470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  31.26 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  31.14 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  29.43 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  27.25 
 
 		 435 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.12 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.94 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  31.54 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  28.14 
 
 		 568 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  32.94 
 
 		 392 aa  92.8  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.95 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  30.05 
 
 		 692 aa  92.8  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  28.85 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.21 
 
 		 421 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  28.99 
 
 		 438 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.08 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.08 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.08 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  26.03 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  28.47 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.28 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  25.97 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.59 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  29.72 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  28 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  26.52 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  28.18 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  25.25 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  28.86 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  25.25 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.39 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  25.33 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  28.42 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  26.1 
 
 		 680 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  33.17 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.4 
 
 		 432 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.79 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.11 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.58 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.81 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  28.92 
 
 		 1031 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.73 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  24.13 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.12 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.33 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.68 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.68 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.86 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  29.04 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  29.03 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.68 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  30.05 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  27.42 
 
 		 702 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.75 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  26.39 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  32.92 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27.69 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  25.85 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  29.4 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  25.54 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  28.57 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  35.48 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  23.73 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.45 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  24.2 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  24.25 
 
 		 585 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.46 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  29.13 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  23.94 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  27.68 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  27.86 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  29.78 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.53 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  28.43 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0846  amidohydrolase  23.67 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  27.06 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  28.68 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  28.68 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.65 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  29.55 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  26.62 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  25.14 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  24.88 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  25.06 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  27.05 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.12 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  27.59 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  31.66 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.1 
 
 		 1005 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  48.42 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.12 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>