More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0032 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  76.64 
 
 		 525 aa  731    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  79.31 
 
 		 464 aa  785    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  100 
 
 		 460 aa  957    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  61.85 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  58.22 
 
 		 475 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  55.46 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  55.78 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  41.77 
 
 		 560 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  42.75 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  36.97 
 
 		 461 aa  259  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  36.16 
 
 		 1046 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  34.07 
 
 		 1498 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  35.75 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  36.86 
 
 		 988 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  35.29 
 
 		 839 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  35.37 
 
 		 1005 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  37.18 
 
 		 1018 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  35.08 
 
 		 1029 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  37.25 
 
 		 763 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  35.61 
 
 		 1024 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  35.09 
 
 		 1024 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  34.87 
 
 		 1024 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  36.41 
 
 		 1029 aa  230  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  36.76 
 
 		 1029 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  35.97 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  35.84 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  35.61 
 
 		 1010 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  34.6 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  34.6 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  34.72 
 
 		 1021 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  36.18 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  36.43 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  34.74 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  35.98 
 
 		 908 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  34.08 
 
 		 1010 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  34.63 
 
 		 1024 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  35.4 
 
 		 1020 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  36.02 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  36.27 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  35.14 
 
 		 424 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  33.85 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  33.58 
 
 		 400 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  33.51 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  34.99 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  33.25 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  33.09 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  34.64 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  33 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.25 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.09 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  34.86 
 
 		 385 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.74 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  32.52 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  31.81 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  32.83 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  33.51 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  32.91 
 
 		 386 aa  183  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  34.13 
 
 		 420 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.17 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  28.75 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  30.69 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  32.75 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  28.36 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  32.26 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  29.92 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  27.56 
 
 		 381 aa  147  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  29.77 
 
 		 376 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  29.52 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  28.39 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  28.39 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  29.26 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  28.13 
 
 		 376 aa  143  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  29.26 
 
 		 376 aa  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  29.52 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  29.52 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  29.52 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  27.79 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  27.59 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  27.55 
 
 		 401 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  27.79 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  26.48 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.75 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.17 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  24.2 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  24.51 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  23.09 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03850  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  22.69 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  24.36 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  23.92 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.33 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  24.12 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  36.36 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  43.28 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  23.95 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  36.36 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  39.02 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  23.76 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  35.61 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>