More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2105 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  100 
 
 		 461 aa  954    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  44.58 
 
 		 441 aa  359  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  48.53 
 
 		 1005 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  46.93 
 
 		 1046 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  47.06 
 
 		 1010 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  47.22 
 
 		 1018 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  45.92 
 
 		 988 aa  343  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  44.75 
 
 		 1024 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  44.8 
 
 		 1020 aa  342  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  44.5 
 
 		 1024 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  45.92 
 
 		 763 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  46.17 
 
 		 839 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  44.25 
 
 		 1024 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  45.02 
 
 		 1029 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  44.94 
 
 		 1029 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  44.83 
 
 		 908 aa  335  7.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  45.66 
 
 		 1029 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  46 
 
 		 1498 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  45.8 
 
 		 1024 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  44.2 
 
 		 1021 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  43.43 
 
 		 1010 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  45.82 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  38.46 
 
 		 464 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  38.65 
 
 		 475 aa  266  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  37.47 
 
 		 471 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  36.97 
 
 		 460 aa  259  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  35.8 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  37.47 
 
 		 525 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  36.29 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  36.29 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  38.82 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  35.93 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  35.4 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  34.58 
 
 		 560 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  35.68 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  34.86 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  36.66 
 
 		 385 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  34.51 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  34.26 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  34.83 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  36.5 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  36.41 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  35.48 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  34.66 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  34.18 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  35.63 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  35.79 
 
 		 384 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  35.04 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  36.41 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.67 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  34.66 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  32.99 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  34.69 
 
 		 381 aa  193  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.61 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  33.58 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  33.93 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  32.09 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  32.16 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  32.74 
 
 		 384 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  31.9 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  32.49 
 
 		 392 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  30.83 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  33.67 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  33.67 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  30.58 
 
 		 382 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.1 
 
 		 390 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  30.49 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  30.41 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  30.67 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  30.67 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  30.67 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  30.41 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  30.15 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  30.15 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  30.67 
 
 		 376 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  30.41 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  30.15 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  28.19 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  29.16 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  26.39 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  27.14 
 
 		 420 aa  113  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  26.72 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  26.3 
 
 		 421 aa  87  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  22.67 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.35 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  26.3 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  26.5 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  23.34 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  26.62 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  25.78 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  24.68 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  25.13 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  22.93 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  24.76 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  24.61 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  22.68 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  23.81 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  22.82 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  25.53 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  40 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>