228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4500 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  100 
 
 
429 aa  875    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  34.69 
 
 
443 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  34.99 
 
 
385 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  35.51 
 
 
383 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  32.25 
 
 
396 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  32.73 
 
 
385 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  34.44 
 
 
1498 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  35.66 
 
 
441 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  33.85 
 
 
387 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  32.47 
 
 
385 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  31.77 
 
 
386 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  32.31 
 
 
400 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  31.46 
 
 
396 aa  186  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.43 
 
 
402 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  30.52 
 
 
402 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  30.13 
 
 
388 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  30.6 
 
 
389 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  30 
 
 
438 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  30.55 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  30.93 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  31.94 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  31.76 
 
 
385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  31.07 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  33.17 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  30.75 
 
 
448 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.69 
 
 
403 aa  173  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  30.59 
 
 
448 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  29.55 
 
 
429 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  29 
 
 
467 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.4 
 
 
412 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  29.76 
 
 
428 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  30.3 
 
 
448 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  30.69 
 
 
401 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  31.69 
 
 
388 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  30.35 
 
 
420 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  29.55 
 
 
429 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  30.92 
 
 
422 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  30.56 
 
 
439 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  31.17 
 
 
384 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  29.33 
 
 
429 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  29.3 
 
 
384 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  29.3 
 
 
386 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  30.23 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  30.08 
 
 
379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  30.2 
 
 
430 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  29.85 
 
 
424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  30.85 
 
 
386 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  29.23 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  29.97 
 
 
389 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  31.52 
 
 
420 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  31.63 
 
 
429 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  27.63 
 
 
435 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  29.68 
 
 
447 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  31.35 
 
 
434 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  29.34 
 
 
381 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  29.31 
 
 
436 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  27.79 
 
 
392 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  30.28 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.08 
 
 
390 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  29.38 
 
 
433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  30.48 
 
 
382 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  26.41 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  30.45 
 
 
471 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  29 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  27.89 
 
 
376 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  26.93 
 
 
1010 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  27.61 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  28.57 
 
 
376 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  28.57 
 
 
376 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  28.57 
 
 
376 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  28.57 
 
 
376 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  26.43 
 
 
1005 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  27.32 
 
 
373 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  28.27 
 
 
376 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  28.27 
 
 
376 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  27.32 
 
 
376 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  28.25 
 
 
470 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  28.18 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  27.66 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  26.09 
 
 
461 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  27.41 
 
 
418 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  29.53 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  26.44 
 
 
908 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  28.18 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  24.81 
 
 
1010 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  25.4 
 
 
582 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
1018 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  23.99 
 
 
1024 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  24.56 
 
 
1046 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  27.83 
 
 
525 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  25.56 
 
 
475 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  26.1 
 
 
560 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  23.75 
 
 
1024 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  24.17 
 
 
1024 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  27.79 
 
 
460 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  25.12 
 
 
1029 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  25.68 
 
 
1020 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  24.15 
 
 
1021 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  24.07 
 
 
988 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  24.38 
 
 
1024 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>