More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2239 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  100 
 
 		 385 aa  776    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  98.7 
 
 		 385 aa  764    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  57.96 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  55.06 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  53.69 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  52.79 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  52.94 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  50.39 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  49.74 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  47.74 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  47.67 
 
 		 385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  48.39 
 
 		 384 aa  362  8e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  49.87 
 
 		 389 aa  362  9e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  49.08 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  45.82 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  44.2 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.55 
 
 		 403 aa  338  9e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  44.68 
 
 		 385 aa  331  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  44.24 
 
 		 376 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  43.19 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  44.06 
 
 		 376 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  44.44 
 
 		 373 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  44.59 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  44.59 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  44.06 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  44.59 
 
 		 376 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  44.59 
 
 		 376 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  44.59 
 
 		 376 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  44.33 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  42.11 
 
 		 388 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  43.01 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  43.8 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  42.75 
 
 		 379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  43.78 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  40.27 
 
 		 402 aa  318  7.999999999999999e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  43.56 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  42.01 
 
 		 387 aa  316  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  41.05 
 
 		 412 aa  315  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  41.36 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  39.22 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  39.22 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  40.93 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.51 
 
 		 390 aa  305  6e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  43.04 
 
 		 386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  41.42 
 
 		 381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  41.6 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  34.68 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  32.47 
 
 		 429 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  33.59 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  33.84 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  31.44 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  34.76 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  33.67 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  30.28 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  32.26 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  31.68 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  29.97 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  32.05 
 
 		 988 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  31.09 
 
 		 525 aa  170  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  31.73 
 
 		 1005 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  30.55 
 
 		 469 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  30.42 
 
 		 1046 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  29.95 
 
 		 839 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  29.7 
 
 		 763 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  29.44 
 
 		 1029 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  29.7 
 
 		 1029 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  30.3 
 
 		 1010 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  29.37 
 
 		 1029 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  32.41 
 
 		 1498 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  31.04 
 
 		 443 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  28.43 
 
 		 1024 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  28.17 
 
 		 1024 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  28.43 
 
 		 1024 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  29.47 
 
 		 1024 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  29.47 
 
 		 1021 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  30.79 
 
 		 908 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  26.84 
 
 		 1010 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 1018 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  27.88 
 
 		 424 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  27.3 
 
 		 1020 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  26.85 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  26.04 
 
 		 444 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  29.1 
 
 		 421 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  26.89 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.41 
 
 		 430 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  27.93 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  25.43 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  26.49 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  27.15 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  35.75 
 
 		 560 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  26.51 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  28.81 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  26.09 
 
 		 438 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  25.26 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  27.1 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  26.56 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  24.94 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  27.25 
 
 		 447 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  26.23 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>