More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0500 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  100 
 
 		 379 aa  768    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  69.03 
 
 		 385 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  63.35 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  63.35 
 
 		 386 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  60.68 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  48.96 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  48.3 
 
 		 383 aa  358  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  47.53 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  47.09 
 
 		 384 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  47.21 
 
 		 396 aa  348  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  46.97 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  44.44 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  45.19 
 
 		 387 aa  335  9e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  43.95 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  44.76 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  44.24 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  45.04 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  42.09 
 
 		 376 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  43.16 
 
 		 397 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  45.71 
 
 		 386 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.24 
 
 		 402 aa  322  7e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  41.94 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  42.09 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  42.09 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  42.09 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  42.09 
 
 		 376 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  42.09 
 
 		 376 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  42.09 
 
 		 376 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  41.82 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  42.63 
 
 		 388 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  42.36 
 
 		 376 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  41.55 
 
 		 376 aa  316  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.23 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  44.33 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  44.59 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.59 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.89 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  42.75 
 
 		 385 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  43.01 
 
 		 385 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  40.99 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  41.55 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  39.95 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  41.62 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  43.23 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  40.11 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  38.08 
 
 		 392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  37.53 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  36.27 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  35.11 
 
 		 441 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  35.84 
 
 		 460 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  34.51 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  36.46 
 
 		 470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  37.31 
 
 		 908 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  36.36 
 
 		 988 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  33.99 
 
 		 469 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  33.33 
 
 		 475 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  34.75 
 
 		 471 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  34.54 
 
 		 1005 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  33.72 
 
 		 560 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  32.91 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  32.66 
 
 		 1024 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  32.41 
 
 		 1024 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  32.57 
 
 		 1024 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  32.32 
 
 		 763 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  32.06 
 
 		 1029 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  32.41 
 
 		 1010 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  32.88 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  31.81 
 
 		 1029 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  31.55 
 
 		 839 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  31.9 
 
 		 1029 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  31.9 
 
 		 1024 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  33.15 
 
 		 378 aa  179  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  31.09 
 
 		 1020 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  30.9 
 
 		 1010 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  30.89 
 
 		 1046 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  30.63 
 
 		 1021 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 1018 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  33.25 
 
 		 1498 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.08 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  31.15 
 
 		 401 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  27.11 
 
 		 430 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  26.72 
 
 		 444 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  26.14 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  25.27 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  26.74 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  26.37 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  25.28 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  24.93 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  22.14 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  25.88 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  24.28 
 
 		 439 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  24.69 
 
 		 447 aa  93.2  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  23.5 
 
 		 424 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  21.72 
 
 		 438 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  23.91 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  22.51 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  23.98 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  21.95 
 
 		 448 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  21.95 
 
 		 448 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  21.39 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>