112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0033 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  100 
 
 		 430 aa  867    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  56.52 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  51.64 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  34.65 
 
 		 444 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  33.03 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  33.6 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  33.25 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  32.05 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  29.83 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  30.3 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  30.52 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  30.75 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  32.39 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  31.78 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  30.28 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  29 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  31.65 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  29.83 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  29.98 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  28.06 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  30.5 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  31.72 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  31.13 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  29.85 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  27.92 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  27.92 
 
 		 384 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  29.64 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  28.46 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  29.53 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  26.63 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.92 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  25.7 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  26.89 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  25.87 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  27.87 
 
 		 1498 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  26.34 
 
 		 385 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  25.27 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  27.25 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  27.02 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.46 
 
 		 403 aa  103  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  26.82 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.69 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  26.55 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  27.04 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  25.38 
 
 		 389 aa  99.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  25.07 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  26.61 
 
 		 386 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  25 
 
 		 385 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  27.3 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  26.6 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  26.55 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  26.2 
 
 		 384 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  24.48 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.35 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  26.75 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  27.66 
 
 		 988 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  23.98 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  26.13 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  24.61 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  26.68 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  23.03 
 
 		 396 aa  86.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  25.52 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  25.97 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  24.2 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  26.55 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  24.29 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  24.29 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  24.29 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  24.71 
 
 		 1046 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  24.16 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  24.03 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  24.29 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  24.03 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  24.04 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  24.16 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  24.7 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  24.03 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  25.14 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  25.34 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  25.06 
 
 		 1024 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  24.71 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  24.61 
 
 		 1024 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 1018 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  24.76 
 
 		 1024 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  23.83 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  23.19 
 
 		 1024 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  24.82 
 
 		 1029 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  23.99 
 
 		 908 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  27.05 
 
 		 1020 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  23.91 
 
 		 839 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  26.38 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  23.97 
 
 		 1029 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  25.06 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  24.07 
 
 		 763 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  21.84 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  23.73 
 
 		 1029 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  23.17 
 
 		 1005 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  24.27 
 
 		 1010 aa  63.9  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  23.88 
 
 		 1021 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  24.3 
 
 		 1010 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>