More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1547 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  100 
 
 
385 aa  780    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  69.03 
 
 
379 aa  546  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  63.68 
 
 
386 aa  532  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  63.68 
 
 
384 aa  532  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  60.16 
 
 
386 aa  465  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  46.74 
 
 
388 aa  351  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  45.83 
 
 
389 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.08 
 
 
402 aa  331  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  44.38 
 
 
384 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  43.08 
 
 
396 aa  329  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  42.93 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  44.01 
 
 
387 aa  325  9e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  45.18 
 
 
400 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.57 
 
 
412 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.34 
 
 
403 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  43.46 
 
 
383 aa  318  9e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  41.56 
 
 
385 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  45.45 
 
 
385 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  44.68 
 
 
385 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  42.86 
 
 
388 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  44.05 
 
 
390 aa  316  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  43.34 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  41.93 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  44.81 
 
 
386 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  43.01 
 
 
385 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  42.38 
 
 
403 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  40.99 
 
 
386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  39.84 
 
 
424 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  41.6 
 
 
396 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  41.71 
 
 
382 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  43.68 
 
 
381 aa  295  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  38.76 
 
 
384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  38.2 
 
 
376 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  38.03 
 
 
373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  38.2 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  38.2 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  38.2 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  38.2 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  38.2 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  38.2 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  38.2 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  38.2 
 
 
376 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  37.4 
 
 
376 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  39.79 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  38.32 
 
 
420 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  38.85 
 
 
389 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  36.43 
 
 
460 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  35.01 
 
 
441 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  35.68 
 
 
461 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  36.07 
 
 
471 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  36.67 
 
 
469 aa  219  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  36.09 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  34.56 
 
 
525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  36.24 
 
 
470 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  34.01 
 
 
429 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  33.42 
 
 
475 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  35.95 
 
 
988 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  34.1 
 
 
1005 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  33.42 
 
 
908 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  31.83 
 
 
1046 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  32.31 
 
 
1010 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  29.63 
 
 
560 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  33.07 
 
 
1018 aa  176  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  32.48 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  31.9 
 
 
378 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  30.42 
 
 
1020 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  29.5 
 
 
763 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  29.4 
 
 
1010 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  29.22 
 
 
1024 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  28.97 
 
 
1024 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  29.75 
 
 
1021 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  29 
 
 
839 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  28.97 
 
 
1024 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  30.5 
 
 
1024 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  28.97 
 
 
1029 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  28.75 
 
 
1029 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  29.81 
 
 
424 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  28.5 
 
 
1029 aa  159  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  31.57 
 
 
1498 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  26.41 
 
 
429 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  25.74 
 
 
444 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  27.08 
 
 
443 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.13 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  25.96 
 
 
435 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  26.82 
 
 
430 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  26.9 
 
 
439 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  23.85 
 
 
424 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  23.9 
 
 
430 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  26.5 
 
 
422 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  26.75 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  24.47 
 
 
436 aa  96.3  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  24.27 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  25.77 
 
 
429 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  26.03 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  23.82 
 
 
467 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  26.55 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  24.67 
 
 
447 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  24.62 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  25.58 
 
 
428 aa  86.3  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  24.36 
 
 
448 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>