117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2858 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  959    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  59.02 
 
 		 439 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  58.53 
 
 		 435 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  60.4 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  56.52 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  56.24 
 
 		 429 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  56.95 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  55.78 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  56.01 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  54.8 
 
 		 438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  55.86 
 
 		 448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  56.73 
 
 		 448 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  45.54 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  35.42 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  33.12 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  32.25 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  33.26 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  34.29 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  31.36 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  30.19 
 
 		 1498 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  29 
 
 		 429 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  28.22 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  27.29 
 
 		 386 aa  123  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  27.25 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  29.64 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  27.84 
 
 		 424 aa  116  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  25.35 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  26.65 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  29.3 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  26.88 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  25.12 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  26.72 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  27.93 
 
 		 386 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  24.89 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  26.73 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  26.52 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.85 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  25.23 
 
 		 424 aa  97.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.49 
 
 		 383 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  23.2 
 
 		 402 aa  96.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  24.27 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  26.55 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  23.82 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  24.94 
 
 		 403 aa  90.5  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  26.33 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  21.92 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  24.04 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  25 
 
 		 389 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  24.24 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  27.27 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.56 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  21.18 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  23.24 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  23.63 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  26.39 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.43 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  22.88 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  23.68 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  24.17 
 
 		 908 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  23.11 
 
 		 988 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  23.37 
 
 		 1005 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  22.27 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.88 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  23.82 
 
 		 1010 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  20.63 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  24.33 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  24.42 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  21.91 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  23.95 
 
 		 441 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  23.39 
 
 		 1020 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  23.4 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  22.06 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  23.81 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  22.06 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  22.47 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  22.47 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  23.87 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  22.47 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  22.47 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  22.47 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  22.47 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  22.47 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  22.47 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  22.33 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  21.43 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  21.81 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  21.49 
 
 		 1024 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  21.62 
 
 		 1029 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  20.55 
 
 		 1024 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  22.35 
 
 		 1018 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  22.85 
 
 		 1024 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  20.98 
 
 		 464 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  23.73 
 
 		 1010 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  22.88 
 
 		 1046 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  20.55 
 
 		 1024 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  20.05 
 
 		 582 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  22.25 
 
 		 1029 aa  53.9  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  21.61 
 
 		 1029 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  22.2 
 
 		 839 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>