115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12683 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  100 
 
 
447 aa  920    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  44.88 
 
 
433 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  46.9 
 
 
436 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  44.57 
 
 
430 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  41.53 
 
 
434 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  36.51 
 
 
439 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  37.65 
 
 
428 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  37.65 
 
 
429 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  37.65 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  35.45 
 
 
435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  36.19 
 
 
422 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  36.22 
 
 
448 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  35.36 
 
 
448 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  35.7 
 
 
448 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  36.92 
 
 
429 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  36.97 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  35.32 
 
 
419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  31.82 
 
 
467 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  30.1 
 
 
1498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  28.94 
 
 
443 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  29.68 
 
 
429 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  28.35 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  27.12 
 
 
444 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  26.2 
 
 
385 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  27.55 
 
 
384 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  26.56 
 
 
385 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  24.8 
 
 
386 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  24.8 
 
 
384 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  27.78 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  24.82 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  26.15 
 
 
430 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  27.25 
 
 
385 aa  96.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  23.97 
 
 
401 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  24.69 
 
 
379 aa  93.2  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  27.49 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  24.67 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  24.87 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  23.97 
 
 
424 aa  90.1  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.26 
 
 
383 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  26.1 
 
 
388 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.22 
 
 
402 aa  89  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  27.3 
 
 
389 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  24.2 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  23.69 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  24.75 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  25 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  23.25 
 
 
400 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  24.32 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  25.12 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  25.44 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  23.47 
 
 
525 aa  80.1  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  24.6 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  24.42 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.46 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  26.2 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  25.73 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  24.42 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  25.67 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  22.67 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  24.31 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  25.67 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  25.73 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  25.44 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  25.73 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  24.2 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  25.73 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  21.84 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  22.32 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  25.68 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  25.07 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  22.78 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  32.75 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.44 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  25.07 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  21.13 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  21.41 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  25.53 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  23 
 
 
461 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  23.44 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  23.99 
 
 
908 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  22.74 
 
 
988 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  20.91 
 
 
460 aa  57  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  22.58 
 
 
1020 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  21.96 
 
 
424 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  27.85 
 
 
420 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  21.68 
 
 
378 aa  53.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  19.6 
 
 
582 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  19.55 
 
 
469 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  31.78 
 
 
1065 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  22.06 
 
 
470 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  22.61 
 
 
1018 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  34 
 
 
1071 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.85 
 
 
1062 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25.85 
 
 
1062 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  27.56 
 
 
598 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  21.14 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  28.35 
 
 
1081 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  25.26 
 
 
1010 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  36.08 
 
 
1138 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  27.56 
 
 
1062 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>