234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0079 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  71.17 
 
 		 470 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  100 
 
 		 471 aa  968    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  62.66 
 
 		 475 aa  574  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  56.98 
 
 		 525 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  55.46 
 
 		 460 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  58.76 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  54.13 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  44.4 
 
 		 560 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  43.14 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  37.47 
 
 		 461 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  39.66 
 
 		 1018 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  35.01 
 
 		 763 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  35 
 
 		 839 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  34.9 
 
 		 1029 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  35.86 
 
 		 988 aa  254  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  38.35 
 
 		 1005 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  34.06 
 
 		 1029 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  35.29 
 
 		 1024 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  35.01 
 
 		 1029 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  35.29 
 
 		 1024 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  35.06 
 
 		 1024 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  36.68 
 
 		 1010 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  36.79 
 
 		 424 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  37.5 
 
 		 1020 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  34.75 
 
 		 1046 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  35.71 
 
 		 1498 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  34.41 
 
 		 1021 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  34.5 
 
 		 1010 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  34.4 
 
 		 1024 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  38.79 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  35.63 
 
 		 908 aa  226  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  39.57 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  38.12 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  39.23 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  35.46 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  38.93 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  36.07 
 
 		 385 aa  219  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  37.2 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  36.68 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  37.2 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  37.66 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  35.97 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  34.67 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  39.68 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  37.37 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  37.8 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  37.84 
 
 		 386 aa  207  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  34.75 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  35.62 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  34.46 
 
 		 396 aa  199  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  36.34 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  34.36 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  34.26 
 
 		 384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  33.67 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  34.44 
 
 		 385 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  37.85 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  33.42 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  34.18 
 
 		 386 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  35.97 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  34.92 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  34.92 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  32.91 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  31.93 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  31.3 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  32.08 
 
 		 373 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  32.08 
 
 		 376 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  32.08 
 
 		 376 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  32.08 
 
 		 376 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  31.62 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  31.89 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  31.89 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  31.89 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  32.08 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  31.35 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  31.27 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  29.02 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  30.08 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.45 
 
 		 429 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  28.64 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  28.1 
 
 		 378 aa  120  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  26.65 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  27.97 
 
 		 421 aa  97.8  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  27.71 
 
 		 444 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.55 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  27.25 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  24.14 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  26.33 
 
 		 420 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  24.7 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  23.74 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.46 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  24.51 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  24.46 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  24.26 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  24.26 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  26.65 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  24.72 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  24.32 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  23.91 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  25.94 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  24.4 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>