124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2998 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  83.76 
 
 
428 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  82.35 
 
 
429 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  83.06 
 
 
429 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  83.29 
 
 
429 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  80.8 
 
 
438 aa  734    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  97.54 
 
 
448 aa  897    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  916    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  96.43 
 
 
448 aa  887    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  57.74 
 
 
439 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  58.47 
 
 
422 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  56.22 
 
 
435 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  55.78 
 
 
467 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  48.62 
 
 
419 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  35.65 
 
 
430 aa  272  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  37.1 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  36.89 
 
 
436 aa  259  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  36.22 
 
 
447 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  34.99 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  32.56 
 
 
443 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  31.63 
 
 
1498 aa  183  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.59 
 
 
429 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  30.5 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  28.83 
 
 
424 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  25.3 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  27.14 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  29.01 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  27.27 
 
 
420 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  28.24 
 
 
385 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  25.37 
 
 
389 aa  106  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  28.5 
 
 
430 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  27.67 
 
 
386 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  26.37 
 
 
401 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  24.32 
 
 
386 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  24.19 
 
 
384 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  25.51 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  25.37 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.31 
 
 
383 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  24.75 
 
 
385 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  23.28 
 
 
400 aa  93.2  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  25.32 
 
 
384 aa  90.1  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  26.68 
 
 
382 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  24.7 
 
 
429 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  25.07 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  23.96 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  26.65 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  21.8 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.92 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  22.2 
 
 
379 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  25.17 
 
 
988 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.13 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.55 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  25.95 
 
 
908 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  24.77 
 
 
1005 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  27 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  24.88 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  24.42 
 
 
385 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  23.08 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  26.76 
 
 
1010 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  24.25 
 
 
1010 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  23.72 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  24.11 
 
 
763 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  23.21 
 
 
1029 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  26.57 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  22.45 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  24.12 
 
 
1029 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  24.12 
 
 
839 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  24.78 
 
 
1046 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  25.74 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  26.3 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  24.26 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  24.76 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  22.86 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  22.36 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  23.42 
 
 
1029 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  25.62 
 
 
1020 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  24.27 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  26 
 
 
469 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  22.95 
 
 
1024 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  22.95 
 
 
475 aa  70.1  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  24.47 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  26.1 
 
 
1024 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  25.19 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  23.18 
 
 
1024 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  24.46 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  24.7 
 
 
1021 aa  67  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  22.73 
 
 
1024 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  23.32 
 
 
461 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  24.47 
 
 
1018 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  23.66 
 
 
388 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  21.32 
 
 
582 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  30.85 
 
 
460 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  23.74 
 
 
470 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  23.2 
 
 
386 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.35 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  22.81 
 
 
525 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  21.45 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  38.75 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  22.19 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.77 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  43.75 
 
 
456 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>