More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0524 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  100 
 
 
397 aa  800    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  73.38 
 
 
402 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  69.48 
 
 
403 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  69.69 
 
 
424 aa  524  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  67.89 
 
 
407 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  63.57 
 
 
412 aa  498  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  60.62 
 
 
403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  59.11 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  60.31 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  59 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  58.44 
 
 
390 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  50.26 
 
 
385 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  47.24 
 
 
383 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  47.52 
 
 
387 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  48.04 
 
 
385 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  44.86 
 
 
400 aa  349  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  46.49 
 
 
384 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  45.65 
 
 
388 aa  346  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  46.39 
 
 
396 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  44.01 
 
 
384 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  44.56 
 
 
386 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  43.26 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  45.38 
 
 
386 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  44.56 
 
 
386 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  48.07 
 
 
389 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  45.82 
 
 
385 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  44.95 
 
 
381 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  43.16 
 
 
379 aa  323  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  47.11 
 
 
386 aa  323  4e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  45.55 
 
 
385 aa  322  7e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  46.32 
 
 
384 aa  318  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  41.93 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  42.41 
 
 
382 aa  309  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  44.32 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  40.43 
 
 
376 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  40.16 
 
 
376 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  39.89 
 
 
376 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  39.89 
 
 
376 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  39.89 
 
 
376 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  39.89 
 
 
376 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  39.89 
 
 
376 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  40.87 
 
 
373 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  39.89 
 
 
376 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  39.63 
 
 
376 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  39.1 
 
 
376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  37.63 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  36.5 
 
 
461 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  37.8 
 
 
471 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  32.2 
 
 
525 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  37.4 
 
 
441 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  33.51 
 
 
460 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  35.59 
 
 
429 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  34.67 
 
 
475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  34.39 
 
 
470 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  34.63 
 
 
401 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  33.58 
 
 
469 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  33.69 
 
 
988 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  31.17 
 
 
464 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  34.94 
 
 
1498 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  32.33 
 
 
378 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.93 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  31.95 
 
 
1046 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  35.37 
 
 
444 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  31.33 
 
 
1010 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  31.27 
 
 
1010 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  31.68 
 
 
1018 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  29.55 
 
 
1024 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  30.91 
 
 
1020 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  29.29 
 
 
1024 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  29.55 
 
 
763 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  29.55 
 
 
839 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  29.55 
 
 
1024 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  32.25 
 
 
1005 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  30.96 
 
 
908 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  30.05 
 
 
424 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  29.55 
 
 
1029 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  29.55 
 
 
1029 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  30.53 
 
 
1021 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  29.29 
 
 
1029 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  28.8 
 
 
1024 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  32.41 
 
 
424 aa  149  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  30.84 
 
 
560 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  33.93 
 
 
428 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  28.65 
 
 
443 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  31.44 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  28.13 
 
 
418 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  27.39 
 
 
430 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  26.79 
 
 
436 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  25.07 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  28.61 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  24.23 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.35 
 
 
430 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  28.07 
 
 
439 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  26.95 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  24.24 
 
 
467 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  26.46 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  26.4 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  26.14 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  26.77 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  25.63 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>