More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2892 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  100 
 
 		 385 aa  776    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  58.38 
 
 		 387 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  60.68 
 
 		 386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  56.25 
 
 		 385 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  56.81 
 
 		 389 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  53.93 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  54.76 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  51.15 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  52.93 
 
 		 400 aa  401  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  48.34 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  49.61 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  49.48 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  48.03 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  48.95 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  48.41 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  49.21 
 
 		 403 aa  354  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  48.04 
 
 		 397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  47.14 
 
 		 384 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  47.67 
 
 		 385 aa  348  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  47.93 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  47.23 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.14 
 
 		 403 aa  345  7e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  44.44 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  45.05 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  45.78 
 
 		 384 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  45.78 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  45.08 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  46.65 
 
 		 386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.81 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  44.42 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.6 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  44.76 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  46.55 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  46.2 
 
 		 376 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  46.55 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  46.55 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  46.55 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  45.07 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  46.26 
 
 		 373 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  46.26 
 
 		 376 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  47.55 
 
 		 420 aa  322  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  46.49 
 
 		 376 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  45.91 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  45.38 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  41.56 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  44.23 
 
 		 376 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  37.92 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  36.01 
 
 		 429 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  36.66 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  33.08 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  34.67 
 
 		 525 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  34.86 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  35.1 
 
 		 464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  34.88 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  34.44 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  32.58 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  33.42 
 
 		 469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  32.48 
 
 		 1498 aa  176  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  31.76 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  34.34 
 
 		 443 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  30.93 
 
 		 988 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  29.34 
 
 		 1024 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  29.7 
 
 		 1046 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  29.08 
 
 		 1024 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  29.26 
 
 		 1010 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  31.18 
 
 		 908 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  28.94 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  29.77 
 
 		 1029 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  28.83 
 
 		 1024 aa  156  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  29.38 
 
 		 1010 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  28.93 
 
 		 1024 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  28.83 
 
 		 763 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  29.08 
 
 		 839 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  28.57 
 
 		 1029 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  28.57 
 
 		 1029 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  28.17 
 
 		 1021 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  29.23 
 
 		 424 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  29.6 
 
 		 1020 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  31.25 
 
 		 1005 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  27.7 
 
 		 1018 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  31.19 
 
 		 444 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  27.98 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  39.69 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  27.23 
 
 		 430 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  28.24 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  28.69 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  27.23 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  27.76 
 
 		 434 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  26.34 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  26.2 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  25.76 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  25.36 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  25.63 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  27.1 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  25.19 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  27.48 
 
 		 430 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  25.43 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  24.03 
 
 		 429 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  24.17 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  23.6 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>