More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1389 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  100 
 
 
389 aa  780    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  57.22 
 
 
383 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  55.47 
 
 
385 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  55.5 
 
 
396 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  56.81 
 
 
385 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  55.24 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  54.48 
 
 
400 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  53.65 
 
 
388 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  53.25 
 
 
386 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  53.85 
 
 
384 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  51.05 
 
 
386 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  50.51 
 
 
396 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  51.52 
 
 
381 aa  364  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  47.53 
 
 
379 aa  352  7e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  47.88 
 
 
384 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  47.88 
 
 
386 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  49.87 
 
 
385 aa  348  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  44.71 
 
 
376 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  47.4 
 
 
388 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  49.61 
 
 
385 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  44.71 
 
 
376 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  50.28 
 
 
389 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  45.93 
 
 
402 aa  345  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  44.71 
 
 
376 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  44.71 
 
 
376 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  44.71 
 
 
376 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  44.44 
 
 
376 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  44.18 
 
 
376 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  44.18 
 
 
376 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  44.3 
 
 
373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.47 
 
 
402 aa  343  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  50.68 
 
 
390 aa  342  7e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  45.83 
 
 
385 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  43.65 
 
 
376 aa  338  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  47.01 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  43.65 
 
 
376 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  48.07 
 
 
397 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  44.24 
 
 
384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  46.85 
 
 
403 aa  327  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  46.98 
 
 
386 aa  326  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.66 
 
 
412 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  46.67 
 
 
424 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  41.93 
 
 
382 aa  319  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  43.68 
 
 
420 aa  315  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  45.43 
 
 
407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  44.06 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  35.5 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  36.8 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  35.81 
 
 
441 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  34.66 
 
 
461 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  34.09 
 
 
525 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  36.07 
 
 
470 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  33.25 
 
 
460 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  36.34 
 
 
471 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  34.26 
 
 
475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  34.02 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  33.41 
 
 
469 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  32.97 
 
 
988 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.6 
 
 
429 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  31.84 
 
 
1498 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  29.59 
 
 
378 aa  172  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  30.23 
 
 
1021 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  29.35 
 
 
1046 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  30.13 
 
 
1024 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  31.54 
 
 
1005 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  28.43 
 
 
1010 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  29.8 
 
 
1024 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  29.22 
 
 
763 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  29.55 
 
 
1024 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  29.38 
 
 
1010 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  29 
 
 
1024 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  27.46 
 
 
1020 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  28.79 
 
 
1029 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  29.04 
 
 
1029 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  30.08 
 
 
424 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  33.6 
 
 
443 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  29.04 
 
 
839 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  28.79 
 
 
1029 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  29.87 
 
 
1018 aa  153  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  29.95 
 
 
908 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  31.29 
 
 
444 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  27.44 
 
 
424 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  37.5 
 
 
560 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  31.23 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  29.49 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  25.38 
 
 
430 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.94 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  26.1 
 
 
436 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  25.81 
 
 
435 aa  97.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  27.41 
 
 
430 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  27.25 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  27.17 
 
 
434 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.14 
 
 
430 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  27.47 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  25.73 
 
 
428 aa  90.1  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  24.69 
 
 
467 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  27.3 
 
 
447 aa  87  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  25.26 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  25.66 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  27.72 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>