136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1349 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  92.07 
 
 		 428 aa  777    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  872    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  98.14 
 
 		 429 aa  858    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  96.04 
 
 		 429 aa  830    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  78.54 
 
 		 438 aa  702    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  80.36 
 
 		 448 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  79.69 
 
 		 448 aa  719    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  80.8 
 
 		 448 aa  730    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  60.38 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  58.29 
 
 		 439 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  55.19 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  57.48 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  49.65 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  34.88 
 
 		 430 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  38.14 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  36.55 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  35.94 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  37.12 
 
 		 434 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  32.88 
 
 		 443 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  30.15 
 
 		 1498 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.34 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  30.02 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  30.28 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  31.46 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  26.73 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  29.41 
 
 		 396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  28.78 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  28.15 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  27.68 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  27.06 
 
 		 401 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  26.87 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  25.63 
 
 		 385 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  27.37 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  26.7 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  26.7 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  26.63 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.85 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  26.56 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  24.81 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  26.37 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  25 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  25.2 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  26.85 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  24.26 
 
 		 400 aa  93.6  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  25.77 
 
 		 385 aa  93.2  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  25.55 
 
 		 1005 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  27.32 
 
 		 382 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  25.44 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  24.42 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.33 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  23.62 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  24.6 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  26.43 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  25.72 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.96 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  25.26 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  26.14 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  20.65 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  26.29 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  26.53 
 
 		 908 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  25.85 
 
 		 1046 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  26.98 
 
 		 1010 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  23.93 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  26.18 
 
 		 988 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  25.98 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  25.37 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  25.94 
 
 		 763 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  25.36 
 
 		 1029 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  26.14 
 
 		 1024 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  24.82 
 
 		 1029 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  25.36 
 
 		 839 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  24.69 
 
 		 1021 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  24.32 
 
 		 1024 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  24.05 
 
 		 1010 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  23.81 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  24.82 
 
 		 1029 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  22.22 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  24.34 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  23.83 
 
 		 1024 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  23.82 
 
 		 1024 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  25.24 
 
 		 1018 aa  67  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  25.69 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  24.51 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  21.56 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  25.06 
 
 		 1020 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  23.43 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  23.34 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  24.24 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  21.93 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  24.65 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  35.61 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  31.25 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  23.65 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  21.11 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  21.11 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  21.11 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  22.4 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  21.11 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  21.11 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  21.31 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>