108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2104 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  100 
 
 		 582 aa  1171    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  29.13 
 
 		 1498 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  27.92 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  28.24 
 
 		 1010 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  25.4 
 
 		 429 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  24.77 
 
 		 1005 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  28.64 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  29.44 
 
 		 401 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  23.99 
 
 		 1020 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.71 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  21.83 
 
 		 908 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  24.23 
 
 		 1010 aa  97.4  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  23.91 
 
 		 988 aa  97.4  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  24.71 
 
 		 381 aa  94  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  26.62 
 
 		 384 aa  94  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  23.52 
 
 		 1029 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  23.59 
 
 		 1046 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  23.68 
 
 		 384 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  24.77 
 
 		 1018 aa  90.9  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  24.77 
 
 		 383 aa  90.9  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  24.94 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  24.01 
 
 		 1024 aa  87.8  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  24.19 
 
 		 1024 aa  87  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  23.74 
 
 		 1021 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  24.26 
 
 		 1029 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  25.75 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  23.73 
 
 		 1024 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  22.83 
 
 		 1029 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  22.12 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  22.76 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  23.15 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  24.08 
 
 		 1024 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  22.71 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  22.86 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  23.74 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  23.33 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  24.61 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  22.64 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  22.86 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  23.86 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  24.66 
 
 		 402 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.32 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  24.04 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  24.04 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  23.34 
 
 		 422 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.23 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  23.85 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  22.17 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  22.81 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  24.03 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.72 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  23.13 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  24.11 
 
 		 400 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  22.36 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  22.66 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  24.84 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  20.51 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  23.91 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  20.28 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  20.29 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  23.91 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  22.71 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  24.83 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  22.65 
 
 		 407 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  21.95 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  21.84 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  21.11 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  23.78 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  23.28 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  20.97 
 
 		 429 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  21.32 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  21.01 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  20.67 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  21.37 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  20.09 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  22.25 
 
 		 470 aa  57  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  20.55 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  21.98 
 
 		 433 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  20.05 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  19.6 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  22.89 
 
 		 420 aa  51.2  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  25.09 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  27.13 
 
 		 839 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  21.48 
 
 		 475 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  37.86 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2154  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.5 
 
 		 370 aa  48.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  25 
 
 		 428 aa  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  21.21 
 
 		 461 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  22.75 
 
 		 376 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  37.33 
 
 		 1059 aa  47  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  23.12 
 
 		 376 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  34.41 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2849  amidohydrolase  20.63 
 
 		 234 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  37.84 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  29.91 
 
 		 1084 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  22.73 
 
 		 373 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  23.12 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  23.12 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  23.12 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  23.37 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>