165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3374 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  100 
 
 
420 aa  827    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  38.24 
 
 
424 aa  250  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  34.63 
 
 
418 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  39.8 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  33.25 
 
 
430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  35.96 
 
 
428 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  33.1 
 
 
430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  34.36 
 
 
421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  31.52 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  31.99 
 
 
1498 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  28.82 
 
 
443 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  27.75 
 
 
448 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  28.3 
 
 
429 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  27.17 
 
 
429 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  29.13 
 
 
422 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  27.58 
 
 
429 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  27.27 
 
 
448 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  27.27 
 
 
448 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  31.39 
 
 
419 aa  123  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  27.82 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  26.25 
 
 
435 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  27.54 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  29.21 
 
 
439 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  30.27 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  25.68 
 
 
467 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  27.41 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  25.75 
 
 
396 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  26.51 
 
 
434 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  26.81 
 
 
385 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.37 
 
 
430 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  25.58 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  25.58 
 
 
384 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  28.5 
 
 
441 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  24.76 
 
 
1024 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  24.76 
 
 
1024 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  27.03 
 
 
385 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  26.23 
 
 
381 aa  93.6  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.47 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  23.6 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  25.25 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  25.24 
 
 
1024 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  25.58 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  24.3 
 
 
1024 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  24.83 
 
 
1021 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  32.07 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  22.9 
 
 
1010 aa  90.1  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  27.85 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  27.25 
 
 
1005 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  26.28 
 
 
386 aa  89.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  27.27 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  23.58 
 
 
763 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  23.58 
 
 
1029 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  23.92 
 
 
1029 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  27.46 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  23.53 
 
 
839 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  23.7 
 
 
1029 aa  87  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  23.58 
 
 
1046 aa  86.7  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  22 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  24.73 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  24.47 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  23.94 
 
 
908 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  25.3 
 
 
1018 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  24.87 
 
 
988 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  27.37 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  31.31 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.53 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  23.72 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  22.82 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  26.54 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  27.03 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  20.66 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  26.19 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  25.24 
 
 
1020 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  27.11 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  25.54 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  23.56 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  22.93 
 
 
1010 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  24.28 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  25.8 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  25.44 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  23.85 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  29.94 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  32.03 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  31.37 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  31.37 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.51 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  31.37 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  22.55 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  31.37 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  31.37 
 
 
376 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  31.37 
 
 
376 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  31.37 
 
 
376 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  22.89 
 
 
582 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  31.37 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  23 
 
 
382 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  31.37 
 
 
376 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  30.72 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  24.46 
 
 
460 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  29.59 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  26.04 
 
 
396 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>