More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2020 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  100 
 
 		 387 aa  760    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  58.38 
 
 		 385 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  59.38 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  55.24 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  50.65 
 
 		 383 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  50.77 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  49.21 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  47.57 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  52.48 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  48.43 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  46.41 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  50.78 
 
 		 403 aa  362  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  46.35 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  49.48 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  48.44 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  47.52 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  47.27 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  45.17 
 
 		 386 aa  348  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  47.8 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.06 
 
 		 412 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  46.23 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  44.76 
 
 		 384 aa  342  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  44.76 
 
 		 386 aa  342  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.63 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  45.19 
 
 		 379 aa  335  9e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  50.4 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  46.07 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.13 
 
 		 390 aa  328  8e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  44.01 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  44.68 
 
 		 382 aa  319  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  46.05 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  42.27 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  42.01 
 
 		 385 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  40.87 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  42.22 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  41.36 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  40.23 
 
 		 376 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  40.23 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  41.11 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  40.52 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  40.52 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  39.94 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  40.23 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  40.23 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  40.23 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  40.23 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  40.62 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  36.18 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  36.67 
 
 		 470 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  36.68 
 
 		 471 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  35.86 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  35.18 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  35.52 
 
 		 525 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  34.17 
 
 		 475 aa  209  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  33.42 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  35.87 
 
 		 469 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  35.25 
 
 		 560 aa  195  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  33.85 
 
 		 429 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  32.41 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  30.06 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  32.04 
 
 		 1498 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  32.17 
 
 		 443 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  27.75 
 
 		 1010 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  27.43 
 
 		 1024 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  27.68 
 
 		 839 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  27.18 
 
 		 1024 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  27.54 
 
 		 1029 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  27.43 
 
 		 763 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  27.43 
 
 		 1024 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  27.18 
 
 		 1029 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  28.46 
 
 		 1046 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  28.5 
 
 		 1010 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  27.43 
 
 		 1029 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  34.26 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  28.24 
 
 		 1024 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  29.54 
 
 		 988 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  29.15 
 
 		 1020 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  27.96 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  26.77 
 
 		 1021 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  28.95 
 
 		 1005 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  28 
 
 		 1018 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  29.35 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  27.71 
 
 		 430 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  27.44 
 
 		 908 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  28.46 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  28.64 
 
 		 582 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  28.91 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  26.89 
 
 		 430 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  26.72 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  27.86 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  26.68 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  26.59 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  26.58 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  26.58 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  27.2 
 
 		 428 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  26.13 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  28.42 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  25.93 
 
 		 448 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  31.02 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  26.7 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>