More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1421 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  100 
 
 		 429 aa  868    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  36.88 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  38.59 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  38.08 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  37.14 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  36.7 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  36.01 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  35.88 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  35.88 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  35.46 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  35.52 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  37.3 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  34.65 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  34.47 
 
 		 470 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.8 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  32.41 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  33.83 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  35.86 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  36.8 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  37.72 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  36.92 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  33.16 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  33.08 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  34.01 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  35.05 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  33.41 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  35.59 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  33.68 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  32.16 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  31.63 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  32.91 
 
 		 379 aa  193  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  37.69 
 
 		 390 aa  193  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  31.81 
 
 		 460 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  33.16 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  35.73 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  29.66 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  32.09 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  32.44 
 
 		 908 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  32.14 
 
 		 475 aa  183  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  31.39 
 
 		 763 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  32.11 
 
 		 1024 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  32.64 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  31.81 
 
 		 839 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  32.11 
 
 		 1024 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  30.56 
 
 		 988 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  31.85 
 
 		 1024 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  32.35 
 
 		 424 aa  179  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  31.29 
 
 		 1029 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  31.08 
 
 		 1029 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  29.77 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  31.81 
 
 		 1029 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  29.77 
 
 		 385 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  31.62 
 
 		 1018 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  33.96 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  31.15 
 
 		 1010 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  30.28 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  33.16 
 
 		 1498 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  30.23 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  30.81 
 
 		 469 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  29.93 
 
 		 1046 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  30.73 
 
 		 1021 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  29.03 
 
 		 1005 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  29.77 
 
 		 1020 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  30.45 
 
 		 1024 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  31.87 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  28.43 
 
 		 1010 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  31.01 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  31.82 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  29.97 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  29.97 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  29.97 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  29.97 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  29.97 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  29.97 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  30.05 
 
 		 373 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  29.97 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  29.97 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  29.72 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  29.95 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  30.13 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  27.08 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  31.17 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  28.77 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  25.53 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  27.31 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  25.44 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  31.34 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  24.5 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.71 
 
 		 430 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  25 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  24.88 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  24.32 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  25.12 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  24.75 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  32.07 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.18 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.7 
 
 		 448 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  26.28 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  24.28 
 
 		 448 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  32.11 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>