206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2513 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  41.49 
 
 
1020 aa  731    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  92.2 
 
 
424 aa  835    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  88.91 
 
 
1029 aa  1885    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  85.31 
 
 
1024 aa  1783    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  85.6 
 
 
1024 aa  1794    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  89.98 
 
 
839 aa  1563    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  85.7 
 
 
1024 aa  1792    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  54.48 
 
 
1018 aa  1129    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  90.29 
 
 
763 aa  1420    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  62.63 
 
 
1046 aa  1284    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  39.1 
 
 
988 aa  668    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  100 
 
 
1029 aa  2137    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  64.03 
 
 
1021 aa  1303    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  41.39 
 
 
1005 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  43.05 
 
 
1010 aa  749    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  88.62 
 
 
1029 aa  1891    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  66 
 
 
1024 aa  1327    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  62.63 
 
 
1010 aa  1332    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  51.33 
 
 
908 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  29.57 
 
 
1498 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2849  amidohydrolase  84.58 
 
 
234 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  45.02 
 
 
461 aa  337  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  44.82 
 
 
441 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1509  amidohydrolase  83.96 
 
 
187 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00999968  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  34.9 
 
 
471 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  38.14 
 
 
470 aa  252  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  36.03 
 
 
525 aa  236  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  37.14 
 
 
469 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  36.41 
 
 
460 aa  230  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  36.54 
 
 
464 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  34.51 
 
 
475 aa  226  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  34.22 
 
 
560 aa  220  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  31.34 
 
 
386 aa  185  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  31.34 
 
 
384 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  31.9 
 
 
379 aa  180  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  34.85 
 
 
386 aa  179  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  30.38 
 
 
388 aa  177  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  31.47 
 
 
385 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  32.11 
 
 
429 aa  173  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  31.25 
 
 
402 aa  172  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  30.9 
 
 
384 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  30.92 
 
 
396 aa  163  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  31.03 
 
 
383 aa  160  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  29.55 
 
 
397 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  28.72 
 
 
385 aa  159  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  29.77 
 
 
385 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  31.2 
 
 
388 aa  155  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  29.04 
 
 
389 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  30.9 
 
 
386 aa  154  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  29.5 
 
 
403 aa  150  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  29.95 
 
 
420 aa  150  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  30.15 
 
 
407 aa  147  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.24 
 
 
402 aa  147  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.75 
 
 
390 aa  147  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  29.32 
 
 
424 aa  147  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.05 
 
 
403 aa  146  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  29.49 
 
 
386 aa  144  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  28.1 
 
 
385 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.65 
 
 
412 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  27.03 
 
 
389 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  28.32 
 
 
381 aa  142  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  28.35 
 
 
385 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  27.54 
 
 
387 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  27.53 
 
 
382 aa  138  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  27.81 
 
 
396 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  28.53 
 
 
376 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  28.07 
 
 
392 aa  132  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  28.1 
 
 
376 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  27.01 
 
 
400 aa  128  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  26.07 
 
 
384 aa  127  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  27.34 
 
 
376 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  27.73 
 
 
373 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  27.59 
 
 
376 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  28 
 
 
376 aa  125  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  27.34 
 
 
376 aa  125  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  27.34 
 
 
376 aa  124  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  27.34 
 
 
376 aa  124  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  27.34 
 
 
376 aa  124  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  27.34 
 
 
376 aa  124  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  23.52 
 
 
582 aa  108  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  25.12 
 
 
429 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  24.32 
 
 
443 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  25.51 
 
 
401 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  25.59 
 
 
444 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  23.02 
 
 
420 aa  83.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  25.24 
 
 
428 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  25.83 
 
 
424 aa  80.1  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  24.88 
 
 
428 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.16 
 
 
430 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  23.83 
 
 
448 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  22.16 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  23.42 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  24.82 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  23.42 
 
 
448 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  24.82 
 
 
429 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  22.9 
 
 
438 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  24.44 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  24.4 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  24.5 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  22.91 
 
 
419 aa  66.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>