More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1019 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  100 
 
 
386 aa  781    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  99.74 
 
 
384 aa  776    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  63.68 
 
 
385 aa  532  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  63.35 
 
 
379 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  58.68 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  49.61 
 
 
388 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.17 
 
 
402 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  46.86 
 
 
388 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.76 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  47.95 
 
 
385 aa  355  8.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.42 
 
 
403 aa  352  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  44.79 
 
 
402 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.98 
 
 
390 aa  350  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  47.88 
 
 
389 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  46.15 
 
 
383 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  46.72 
 
 
384 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  44.78 
 
 
400 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  44.76 
 
 
387 aa  342  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  44.79 
 
 
386 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  44.56 
 
 
397 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  42.46 
 
 
396 aa  339  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  45.95 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  45.78 
 
 
385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  46.38 
 
 
407 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  44.15 
 
 
424 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  46.96 
 
 
386 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  44.25 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  43.27 
 
 
376 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  43.01 
 
 
376 aa  318  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  42.48 
 
 
376 aa  318  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  43.01 
 
 
376 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  43.01 
 
 
376 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  43.01 
 
 
376 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  43.01 
 
 
376 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  42.82 
 
 
373 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  42.48 
 
 
376 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  42.74 
 
 
376 aa  316  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  42.48 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  45.05 
 
 
381 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  43.38 
 
 
382 aa  309  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  42.03 
 
 
384 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  40.76 
 
 
420 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  42.45 
 
 
389 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  40 
 
 
385 aa  298  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  39.22 
 
 
385 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  38.92 
 
 
392 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  37.28 
 
 
441 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  36.29 
 
 
461 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  36.32 
 
 
525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  35.88 
 
 
429 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  37.62 
 
 
469 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  35.5 
 
 
464 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  34.6 
 
 
460 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  35.18 
 
 
475 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  37.2 
 
 
471 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  36.34 
 
 
988 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  37.77 
 
 
470 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  35.62 
 
 
1005 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  31.41 
 
 
1024 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  31.16 
 
 
1024 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  33.93 
 
 
908 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  31.16 
 
 
1024 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  31.16 
 
 
763 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  30.9 
 
 
1010 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  31.34 
 
 
1029 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  31 
 
 
1024 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  31.41 
 
 
1046 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  30.9 
 
 
1029 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  30.9 
 
 
839 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  30.65 
 
 
1029 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  31.11 
 
 
1018 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  30.97 
 
 
424 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  30.97 
 
 
560 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  30.73 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  31.59 
 
 
378 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  31.57 
 
 
1010 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  30.65 
 
 
1020 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  29.01 
 
 
1021 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  29.3 
 
 
429 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  31.08 
 
 
1498 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  30.88 
 
 
444 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  30.13 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  27.97 
 
 
430 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  27.92 
 
 
430 aa  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  27.29 
 
 
467 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  27.92 
 
 
439 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  26.88 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  27.37 
 
 
422 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  28.49 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  25.68 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  25.63 
 
 
438 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  27.2 
 
 
419 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  25.57 
 
 
421 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  26.11 
 
 
448 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  25.26 
 
 
430 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  25.93 
 
 
448 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  26.7 
 
 
429 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  26.2 
 
 
429 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.32 
 
 
448 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  24.8 
 
 
447 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>