More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2039 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  100 
 
 		 1498 aa  3049    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  30.13 
 
 		 1029 aa  393  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  29.57 
 
 		 1029 aa  389  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  31.42 
 
 		 839 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  29.76 
 
 		 1029 aa  380  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  28.86 
 
 		 1046 aa  363  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  31.66 
 
 		 763 aa  351  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  29.43 
 
 		 1010 aa  348  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  46 
 
 		 461 aa  335  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  41.53 
 
 		 1024 aa  333  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  42.04 
 
 		 1024 aa  330  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  42.04 
 
 		 1024 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  40.51 
 
 		 441 aa  323  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  40.61 
 
 		 1021 aa  320  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  42.82 
 
 		 1020 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  42.01 
 
 		 424 aa  319  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 1018 aa  315  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  40.05 
 
 		 1024 aa  311  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  41.73 
 
 		 1005 aa  311  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  41.48 
 
 		 1010 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  41.96 
 
 		 908 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  42.11 
 
 		 988 aa  296  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  37.05 
 
 		 475 aa  248  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  36.74 
 
 		 469 aa  245  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  34.07 
 
 		 460 aa  240  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  35.71 
 
 		 471 aa  238  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  35.56 
 
 		 560 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  34.81 
 
 		 470 aa  235  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  34.98 
 
 		 443 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  35.17 
 
 		 464 aa  234  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  33.58 
 
 		 525 aa  224  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  32.82 
 
 		 430 aa  213  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  33.59 
 
 		 439 aa  212  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  32.83 
 
 		 422 aa  208  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  31.58 
 
 		 435 aa  207  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  30.19 
 
 		 467 aa  203  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  35.1 
 
 		 384 aa  201  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  30.65 
 
 		 429 aa  196  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  32.15 
 
 		 419 aa  196  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  35.22 
 
 		 385 aa  195  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  31.36 
 
 		 438 aa  194  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  30.15 
 
 		 429 aa  194  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  30.4 
 
 		 429 aa  194  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  30.23 
 
 		 428 aa  194  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  34.44 
 
 		 429 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  36.76 
 
 		 402 aa  192  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  36.08 
 
 		 407 aa  191  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  32 
 
 		 433 aa  191  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  34.85 
 
 		 396 aa  190  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  35.14 
 
 		 403 aa  189  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  31.87 
 
 		 448 aa  188  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  31.63 
 
 		 448 aa  188  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  33.92 
 
 		 402 aa  187  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  34.52 
 
 		 383 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  33.75 
 
 		 434 aa  184  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  35.44 
 
 		 424 aa  184  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  34.94 
 
 		 397 aa  183  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  31.63 
 
 		 448 aa  183  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  29.24 
 
 		 436 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.39 
 
 		 403 aa  181  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  30.1 
 
 		 447 aa  181  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  33.59 
 
 		 388 aa  180  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.54 
 
 		 412 aa  179  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  33.16 
 
 		 386 aa  179  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  32.99 
 
 		 386 aa  178  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  31.84 
 
 		 389 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  32.48 
 
 		 385 aa  176  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  33.83 
 
 		 420 aa  173  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  29.13 
 
 		 582 aa  173  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  33.16 
 
 		 429 aa  171  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  33.25 
 
 		 379 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  31.08 
 
 		 384 aa  166  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  31.08 
 
 		 386 aa  166  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  30.95 
 
 		 384 aa  166  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  33.25 
 
 		 400 aa  165  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  32.04 
 
 		 387 aa  159  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  30.9 
 
 		 388 aa  157  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  31.57 
 
 		 385 aa  157  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  31.78 
 
 		 386 aa  152  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  30.13 
 
 		 424 aa  152  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  30.54 
 
 		 396 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  32.32 
 
 		 385 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  29.97 
 
 		 389 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  32.32 
 
 		 385 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  31.99 
 
 		 420 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  30.73 
 
 		 381 aa  138  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  31.47 
 
 		 401 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.27 
 
 		 390 aa  135  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  28.64 
 
 		 392 aa  131  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  29.74 
 
 		 376 aa  131  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  29.49 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  30.23 
 
 		 376 aa  129  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  29.49 
 
 		 376 aa  128  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  29.49 
 
 		 376 aa  128  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  29.49 
 
 		 376 aa  128  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  29.49 
 
 		 376 aa  128  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  29.23 
 
 		 376 aa  128  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  30 
 
 		 376 aa  128  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  29.31 
 
 		 444 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  27.52 
 
 		 382 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>