More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4501 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  100 
 
 
441 aa  907    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  45.27 
 
 
461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  44.44 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  46.08 
 
 
1010 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  45.36 
 
 
1018 aa  332  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  44.78 
 
 
1005 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  43.91 
 
 
1024 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  43.1 
 
 
1024 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  44.82 
 
 
1029 aa  325  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  44.25 
 
 
1020 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  42.72 
 
 
469 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  43.65 
 
 
1024 aa  324  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  40.51 
 
 
1498 aa  323  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  43.14 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  41.91 
 
 
988 aa  321  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  43 
 
 
470 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  42.75 
 
 
460 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  43.78 
 
 
1010 aa  319  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  42.68 
 
 
464 aa  319  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  44.04 
 
 
763 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  43.4 
 
 
1029 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  44.3 
 
 
1029 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  43.78 
 
 
839 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  43.01 
 
 
1046 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  43.48 
 
 
1024 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  42.93 
 
 
1021 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  42.04 
 
 
525 aa  309  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  44.63 
 
 
424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  40.31 
 
 
560 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  40.26 
 
 
908 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  37.28 
 
 
386 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  37.22 
 
 
384 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  36.86 
 
 
386 aa  231  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  36.02 
 
 
384 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  36.53 
 
 
385 aa  229  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  35.11 
 
 
379 aa  229  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  34.5 
 
 
396 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  36.88 
 
 
412 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  36.91 
 
 
403 aa  227  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  35.01 
 
 
385 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  34.41 
 
 
400 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  35.88 
 
 
402 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  35.91 
 
 
388 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  36.64 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  35.03 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  33.08 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  36.32 
 
 
396 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  35.81 
 
 
389 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  37.67 
 
 
402 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  33.42 
 
 
387 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  33.83 
 
 
429 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  37.4 
 
 
397 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  34.01 
 
 
386 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  34.62 
 
 
424 aa  202  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  35.81 
 
 
388 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  34.68 
 
 
385 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  34.67 
 
 
407 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  33.25 
 
 
384 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  36.57 
 
 
403 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  35.66 
 
 
429 aa  192  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  34.68 
 
 
385 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  32.68 
 
 
420 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  32.82 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.16 
 
 
390 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  30.77 
 
 
389 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  31.12 
 
 
382 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  28.29 
 
 
392 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  31.35 
 
 
376 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  31.81 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  30.54 
 
 
376 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  30.54 
 
 
376 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  30.54 
 
 
376 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  30.27 
 
 
373 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  30.27 
 
 
376 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  30.54 
 
 
376 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  30.27 
 
 
376 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  30 
 
 
376 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  30 
 
 
376 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  28.11 
 
 
401 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  26.93 
 
 
443 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  27.64 
 
 
378 aa  104  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  26.82 
 
 
424 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  28.5 
 
 
420 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  26.7 
 
 
444 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  29.95 
 
 
428 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.07 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.17 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  23.83 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.37 
 
 
1062 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.26 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  25.12 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  24.32 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  24.37 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  24.7 
 
 
1052 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  25.68 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  24.94 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  22.78 
 
 
447 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  21.95 
 
 
1084 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  26.68 
 
 
419 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  22.6 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>