126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1505 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  100 
 
 
430 aa  889    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  49.55 
 
 
436 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  44.57 
 
 
447 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  45.59 
 
 
433 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  44.1 
 
 
434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  37.96 
 
 
422 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  37.67 
 
 
439 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  35.15 
 
 
467 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  36.43 
 
 
428 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  35.88 
 
 
448 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  35.71 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  37.26 
 
 
419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  35.12 
 
 
429 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  36.12 
 
 
448 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  35.65 
 
 
448 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  35.61 
 
 
429 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  36.23 
 
 
438 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  35.15 
 
 
435 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  32.82 
 
 
1498 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  31.42 
 
 
443 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.2 
 
 
429 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  29.61 
 
 
384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  29.5 
 
 
383 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  27.97 
 
 
386 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  27.97 
 
 
384 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  28.12 
 
 
444 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  28.85 
 
 
396 aa  123  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  27.71 
 
 
387 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  27.23 
 
 
385 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  27.11 
 
 
379 aa  116  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  27.97 
 
 
385 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  27.06 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  26.4 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  28.12 
 
 
386 aa  114  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  25.13 
 
 
385 aa  113  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  27.06 
 
 
388 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  25.71 
 
 
582 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  26.23 
 
 
385 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  26.03 
 
 
388 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  26.02 
 
 
424 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.27 
 
 
412 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  26.58 
 
 
403 aa  107  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  25.95 
 
 
396 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  24.94 
 
 
384 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  25.41 
 
 
385 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  26.11 
 
 
386 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  25.74 
 
 
400 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  26.39 
 
 
403 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  24.93 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.06 
 
 
402 aa  96.3  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  26.34 
 
 
430 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  28 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  25.63 
 
 
429 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  25.14 
 
 
389 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  24.35 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  25.38 
 
 
407 aa  93.6  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  24.55 
 
 
402 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  25.35 
 
 
430 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  25 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  24.88 
 
 
1010 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  25.92 
 
 
469 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  25.55 
 
 
908 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  24.62 
 
 
525 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  23.81 
 
 
1005 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  26.22 
 
 
1018 aa  86.7  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  22.49 
 
 
1020 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  25.55 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  23.56 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  25.25 
 
 
461 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  23.33 
 
 
424 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  26.75 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  24.63 
 
 
839 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  24.58 
 
 
1024 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  24.07 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  24.69 
 
 
1029 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  24.26 
 
 
763 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  24.75 
 
 
1029 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  24.06 
 
 
1024 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  24.3 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  24.64 
 
 
1024 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  25.12 
 
 
1010 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  24.55 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  26.29 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  23.92 
 
 
1024 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  25.95 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  24.17 
 
 
1046 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  24.4 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  25.17 
 
 
460 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  24.16 
 
 
1029 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  25.47 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  24.15 
 
 
1021 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  23.06 
 
 
988 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  26.4 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  24.17 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  23.62 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  23.31 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  23.31 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  23.31 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  23.31 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  23.31 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>