More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1565 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  100 
 
 
386 aa  791    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  58.38 
 
 
383 aa  461  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  55.08 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  56.22 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  54.59 
 
 
396 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  54.71 
 
 
385 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  52.04 
 
 
396 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  51.05 
 
 
389 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  49.48 
 
 
385 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  49.21 
 
 
389 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  50.39 
 
 
385 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  49.87 
 
 
385 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  47.11 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  45.17 
 
 
387 aa  348  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  47.11 
 
 
386 aa  348  9e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  47.79 
 
 
392 aa  348  9e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  44.88 
 
 
402 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  44.79 
 
 
386 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  44.79 
 
 
384 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  44.36 
 
 
403 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  43.95 
 
 
379 aa  331  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  44.56 
 
 
397 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  44.71 
 
 
412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  43.72 
 
 
403 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  42.48 
 
 
381 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  42.3 
 
 
384 aa  317  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  42.86 
 
 
382 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  44.21 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  40.99 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  41.69 
 
 
388 aa  305  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  40.7 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  42.16 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  40.43 
 
 
376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  41.8 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  40.16 
 
 
376 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  40.16 
 
 
376 aa  301  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  39.89 
 
 
376 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  39.89 
 
 
376 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  40 
 
 
373 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  39.89 
 
 
376 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  39.89 
 
 
376 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  39.89 
 
 
376 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  40.83 
 
 
407 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  44.36 
 
 
386 aa  296  5e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  42.11 
 
 
424 aa  295  8e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  39.62 
 
 
376 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  34.86 
 
 
461 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  35.03 
 
 
441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  33.08 
 
 
429 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  34.81 
 
 
401 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  33.42 
 
 
525 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  31.77 
 
 
429 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  32.08 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  32.33 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  33.85 
 
 
470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  32.91 
 
 
460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  31.8 
 
 
469 aa  179  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  33.16 
 
 
1498 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  32.91 
 
 
471 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  32.12 
 
 
443 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  30.29 
 
 
988 aa  170  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  31.35 
 
 
1005 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  30.56 
 
 
1010 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  30.21 
 
 
378 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  32.28 
 
 
908 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  31.41 
 
 
1024 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  29.29 
 
 
1010 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  31.16 
 
 
1024 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  28.64 
 
 
1020 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  31.16 
 
 
1024 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  30.9 
 
 
1029 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  30.65 
 
 
839 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  30.15 
 
 
763 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  30.4 
 
 
1029 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  29.8 
 
 
1018 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  29.9 
 
 
1029 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  29.56 
 
 
1021 aa  149  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  29.36 
 
 
560 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  28.89 
 
 
1046 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  29.65 
 
 
1024 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  30.11 
 
 
424 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  29.21 
 
 
424 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  27.49 
 
 
444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.97 
 
 
422 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  26.75 
 
 
435 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  26.03 
 
 
434 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  26.11 
 
 
430 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  26.89 
 
 
439 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  26.84 
 
 
421 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  25.2 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  25.47 
 
 
429 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  25.07 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  24.27 
 
 
467 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  25.2 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  26.23 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  25.4 
 
 
428 aa  94  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  28.1 
 
 
428 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  24.87 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  24.48 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  24.61 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>