More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3656 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  100 
 
 		 420 aa  806    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  59 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  56.85 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  55.91 
 
 		 403 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  57.21 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  55.31 
 
 		 407 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  54.79 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  56.76 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  52.83 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  50 
 
 		 403 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  51.95 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  45.71 
 
 		 385 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  45.41 
 
 		 383 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  43.39 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  43.8 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  50.4 
 
 		 387 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  44.33 
 
 		 384 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  47.55 
 
 		 385 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  43.68 
 
 		 389 aa  315  9e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  43.47 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  42.36 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  43.01 
 
 		 385 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  43.01 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  42.16 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  40.76 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  40.76 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  43.09 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  45.38 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  43.44 
 
 		 382 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  42.27 
 
 		 376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  41.44 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  41.16 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  41.44 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  41.16 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  41.16 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  41.16 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  41.16 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  40.11 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  41.16 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  41.11 
 
 		 376 aa  282  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  41.11 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  38.3 
 
 		 392 aa  276  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  39.64 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  40.93 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  38.32 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  37.77 
 
 		 389 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  34.66 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  36.39 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  35.73 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  32.68 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  34.13 
 
 		 460 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  31.27 
 
 		 988 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  35.97 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  34.16 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  31.5 
 
 		 525 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  33.83 
 
 		 1498 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  29.31 
 
 		 1010 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  30.35 
 
 		 429 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  34.1 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  35.22 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  30.26 
 
 		 1020 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  30.68 
 
 		 378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  31.89 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  32.86 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  29.1 
 
 		 1046 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  30.33 
 
 		 908 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  28.86 
 
 		 1024 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  28.86 
 
 		 763 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  29.95 
 
 		 1029 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  27.89 
 
 		 1005 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  29.52 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  28.68 
 
 		 1024 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  28.61 
 
 		 839 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  28.61 
 
 		 1029 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  28.39 
 
 		 1024 aa  146  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  28.61 
 
 		 1029 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  26.85 
 
 		 1010 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  29.58 
 
 		 1018 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  27.82 
 
 		 1021 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  30.42 
 
 		 443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  26.19 
 
 		 1024 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  30.71 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  34.59 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  31.71 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  27.39 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  24.26 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  30.03 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  25.14 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  23.9 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  26.13 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  27.03 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.09 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.65 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  26.4 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  24.47 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  31.12 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  23.98 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  26.2 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  23.43 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.49 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>