200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1403 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  96.7 
 
 		 424 aa  865    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  98.05 
 
 		 1024 aa  2081    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  97.75 
 
 		 1024 aa  2007    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  64.55 
 
 		 1021 aa  1312    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  39.49 
 
 		 988 aa  663    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  41.94 
 
 		 1020 aa  745    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  100 
 
 		 1024 aa  2120    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  42.36 
 
 		 1005 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  55.95 
 
 		 1018 aa  1132    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  41.71 
 
 		 1010 aa  716    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  87.29 
 
 		 763 aa  1367    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  63.67 
 
 		 1046 aa  1295    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  87.13 
 
 		 839 aa  1508    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  85.7 
 
 		 1029 aa  1827    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  86.49 
 
 		 1029 aa  1843    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  64.55 
 
 		 1024 aa  1332    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  61.98 
 
 		 1010 aa  1319    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  87.17 
 
 		 1029 aa  1835    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  48.81 
 
 		 908 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2849  amidohydrolase  85.51 
 
 		 234 aa  366  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  44.25 
 
 		 461 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  42.04 
 
 		 1498 aa  330  7e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  43.65 
 
 		 441 aa  325  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1509  amidohydrolase  86.1 
 
 		 187 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00999968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  38.4 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  35.29 
 
 		 471 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  34.34 
 
 		 525 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  36.28 
 
 		 469 aa  234  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  34.73 
 
 		 460 aa  231  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  34.69 
 
 		 475 aa  229  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  34.64 
 
 		 464 aa  226  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  33.78 
 
 		 560 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  31.16 
 
 		 386 aa  187  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  31.16 
 
 		 384 aa  187  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  32.57 
 
 		 379 aa  187  8e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  31.14 
 
 		 388 aa  183  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  34.76 
 
 		 386 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  31.57 
 
 		 385 aa  181  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  32.11 
 
 		 429 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  31.07 
 
 		 402 aa  178  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  28.97 
 
 		 385 aa  165  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  30.9 
 
 		 384 aa  163  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  29.55 
 
 		 397 aa  162  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  30.67 
 
 		 396 aa  161  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  30.5 
 
 		 383 aa  160  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  29 
 
 		 389 aa  157  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  30.67 
 
 		 388 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  28.83 
 
 		 385 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  31.16 
 
 		 386 aa  154  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  30.42 
 
 		 407 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.72 
 
 		 403 aa  151  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  29.25 
 
 		 403 aa  150  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.52 
 
 		 390 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  29.76 
 
 		 386 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.08 
 
 		 402 aa  150  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.67 
 
 		 412 aa  148  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  28.39 
 
 		 420 aa  146  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  29.08 
 
 		 424 aa  143  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  28.15 
 
 		 389 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  27.43 
 
 		 387 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  27.41 
 
 		 392 aa  139  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  27.16 
 
 		 385 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  28.06 
 
 		 396 aa  138  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  27.32 
 
 		 381 aa  138  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  27.56 
 
 		 382 aa  137  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  27.41 
 
 		 385 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  28.53 
 
 		 376 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  27.5 
 
 		 384 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  27.85 
 
 		 376 aa  134  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  27.09 
 
 		 376 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  27.47 
 
 		 373 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  27.34 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  27.73 
 
 		 376 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  27.09 
 
 		 376 aa  129  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  26.76 
 
 		 400 aa  129  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  27.09 
 
 		 376 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  27.09 
 
 		 376 aa  128  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  27.09 
 
 		 376 aa  128  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  27.09 
 
 		 376 aa  128  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  24.17 
 
 		 429 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  25.43 
 
 		 401 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  23.65 
 
 		 582 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  24.16 
 
 		 443 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  24.53 
 
 		 420 aa  88.2  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  25.47 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.06 
 
 		 430 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  24.38 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  25 
 
 		 428 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  23.19 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  23.41 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  23.58 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  21.56 
 
 		 421 aa  71.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  24.07 
 
 		 424 aa  70.5  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  23.18 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  23.83 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  24.45 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  23.83 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  23.83 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  24.52 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  22.71 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>