200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2106 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  100 
 
 		 443 aa  894    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  34.69 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  34.98 
 
 		 1498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  35.71 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  34.13 
 
 		 439 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  33.49 
 
 		 448 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  33.26 
 
 		 448 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  33.02 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  32.78 
 
 		 429 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  32.53 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  31.71 
 
 		 429 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  32.56 
 
 		 448 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  32.19 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  31.42 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  32.54 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  31.36 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  35.14 
 
 		 419 aa  204  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  34.72 
 
 		 424 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  33.76 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  31.38 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  31.38 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  34.9 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  28.94 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  31.81 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  34.34 
 
 		 385 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  30.43 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  32.12 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  30.61 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  31.01 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  32.82 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.84 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.76 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  32.17 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  30.58 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  27.92 
 
 		 582 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  33.6 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  31.91 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  30.73 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  29.77 
 
 		 388 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  30.77 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  31.78 
 
 		 418 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  31.04 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  31.04 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  28.12 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  29.83 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  29.65 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  30.71 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  29.29 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  31.9 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  32.32 
 
 		 388 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  28.65 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.77 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  30.26 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  30.42 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  27.27 
 
 		 381 aa  134  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  30 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  26.93 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  28.19 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  28.92 
 
 		 420 aa  131  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  30.13 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  30.13 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.83 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  30.1 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  27.93 
 
 		 421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  27.94 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  27.49 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  27.45 
 
 		 1046 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  27.54 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  28.13 
 
 		 382 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  26.14 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  27.23 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  24.56 
 
 		 988 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  24.44 
 
 		 1010 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  26.02 
 
 		 1010 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  26.65 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  25.06 
 
 		 839 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  24.38 
 
 		 1020 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  26.81 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  24.32 
 
 		 1024 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  25.48 
 
 		 908 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  26.37 
 
 		 1018 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  26.81 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  24.81 
 
 		 763 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  24.32 
 
 		 1029 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  24.88 
 
 		 1029 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  27.03 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  26.55 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  26.54 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  24.07 
 
 		 1024 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  24.32 
 
 		 1029 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  26.29 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  24.16 
 
 		 1024 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  26.01 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  26.55 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  26.55 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  26.55 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  26.01 
 
 		 376 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  24.31 
 
 		 1005 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  24.49 
 
 		 1021 aa  97.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  26.28 
 
 		 525 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>