More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2749 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  100 
 
 
384 aa  781    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  53.56 
 
 
385 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  54.76 
 
 
385 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  51.58 
 
 
383 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  50.38 
 
 
400 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  53.85 
 
 
389 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  50 
 
 
396 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  48.68 
 
 
388 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  48.43 
 
 
387 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  47.44 
 
 
396 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  49.87 
 
 
386 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  48.92 
 
 
388 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  47.11 
 
 
386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  45.83 
 
 
384 aa  349  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  48.66 
 
 
385 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  47.09 
 
 
379 aa  349  5e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  46.72 
 
 
386 aa  349  6e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  46.72 
 
 
384 aa  348  6e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  46.49 
 
 
397 aa  348  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  50.3 
 
 
376 aa  348  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  45.19 
 
 
402 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  50.3 
 
 
376 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  50 
 
 
376 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  50.3 
 
 
376 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  49.85 
 
 
376 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  50.3 
 
 
376 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  48.39 
 
 
385 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  50.15 
 
 
376 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  49.85 
 
 
373 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  50 
 
 
376 aa  346  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  50 
 
 
376 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  45.85 
 
 
403 aa  346  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  46.07 
 
 
403 aa  346  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  49.42 
 
 
376 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.23 
 
 
412 aa  342  8e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  44.96 
 
 
392 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  46.34 
 
 
424 aa  335  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.05 
 
 
402 aa  333  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  45.57 
 
 
382 aa  332  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  47.49 
 
 
389 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  44.38 
 
 
385 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  47.77 
 
 
386 aa  331  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  44.27 
 
 
407 aa  326  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.34 
 
 
390 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  44.33 
 
 
420 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  43.6 
 
 
381 aa  319  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  35.75 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  36.48 
 
 
470 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  35.25 
 
 
525 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  37.5 
 
 
464 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  36.02 
 
 
441 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  35.41 
 
 
475 aa  228  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  36.71 
 
 
469 aa  225  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  37.3 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  34.67 
 
 
471 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  35.11 
 
 
461 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  33.42 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  35.1 
 
 
1498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  34.23 
 
 
988 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  33.51 
 
 
908 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  29.92 
 
 
378 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  31.17 
 
 
429 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  30.41 
 
 
1005 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  30.9 
 
 
1024 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  29.9 
 
 
763 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  30.9 
 
 
1029 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  30.98 
 
 
1024 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  31.66 
 
 
1021 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  30.4 
 
 
839 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  31.16 
 
 
1024 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  30.73 
 
 
1029 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  30.29 
 
 
1020 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  30.15 
 
 
1029 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  30.4 
 
 
1024 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  30.29 
 
 
1046 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  29.92 
 
 
1010 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  31.07 
 
 
1010 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  30.59 
 
 
424 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  27.71 
 
 
1018 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  30.26 
 
 
443 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  29.61 
 
 
430 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  29.29 
 
 
444 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  41.97 
 
 
560 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  28.68 
 
 
436 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  26.6 
 
 
438 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  27.55 
 
 
447 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  28.02 
 
 
428 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  27.62 
 
 
467 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  28.85 
 
 
430 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  27.64 
 
 
421 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  25.82 
 
 
435 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  26.7 
 
 
419 aa  99.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25.2 
 
 
422 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  25.84 
 
 
448 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  24.86 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  25.58 
 
 
448 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  24.46 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  26.2 
 
 
430 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  25.77 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  26.29 
 
 
439 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>