141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3148 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  886    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  96.23 
 
 		 1024 aa  860    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  95.99 
 
 		 1024 aa  860    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  96.7 
 
 		 1024 aa  863    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  92.22 
 
 		 763 aa  833    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  73.73 
 
 		 1046 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  92.2 
 
 		 1029 aa  834    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  92.22 
 
 		 1029 aa  832    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  71.29 
 
 		 1024 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  72.34 
 
 		 1010 aa  676    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  92.69 
 
 		 1029 aa  836    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  71.13 
 
 		 1021 aa  663    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  91.75 
 
 		 839 aa  828    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  67.59 
 
 		 1018 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  53.04 
 
 		 1020 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  54.77 
 
 		 1005 aa  448  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  52.7 
 
 		 1010 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  50.12 
 
 		 988 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  50.12 
 
 		 908 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  45.82 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  42.01 
 
 		 1498 aa  319  6e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  44.63 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  37.99 
 
 		 470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  36.79 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  34.46 
 
 		 525 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  33.68 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  35.55 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  35.14 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  35.19 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  34.29 
 
 		 560 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  32.88 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  32.8 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  32.35 
 
 		 429 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  30.97 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  34.95 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  30.97 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  32.26 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  30.4 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  30.05 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  29.81 
 
 		 385 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  30.59 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  30.93 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  30.52 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  30.08 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  31.54 
 
 		 407 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  30.26 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  29.65 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.46 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.19 
 
 		 403 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  29.23 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  29.52 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  29.78 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.38 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.08 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  29.38 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  30.11 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  28.12 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  28.23 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  29.34 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  28.07 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  27.96 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  28.15 
 
 		 381 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  26.77 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  27.47 
 
 		 384 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  28.21 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  28.21 
 
 		 376 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  28.21 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  28.21 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  28.21 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  28.21 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  27.52 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  27.52 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  28.21 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  26.82 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  26.54 
 
 		 385 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  26.27 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  26.81 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  26.22 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  23.78 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  24.15 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  26.57 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  22.6 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  25.41 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  24.17 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  23.08 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  22.82 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  24.05 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.91 
 
 		 1062 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  22.06 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  21.96 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  21.7 
 
 		 448 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1349  hypothetical protein  22.4 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307382  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  22.66 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  24.12 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  23.2 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  21.89 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  38.03 
 
 		 1062 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  38.03 
 
 		 1069 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  22.61 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  22.14 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>