211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0955 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  100 
 
 		 470 aa  963    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  69.81 
 
 		 471 aa  683    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  60.71 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  56.38 
 
 		 525 aa  507  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  54.27 
 
 		 460 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  52.74 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  53.78 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  43 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  35.12 
 
 		 1024 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  34.54 
 
 		 1024 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  34.75 
 
 		 839 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  34.33 
 
 		 1024 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  39.18 
 
 		 763 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  38.92 
 
 		 988 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  34.75 
 
 		 1029 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  38.66 
 
 		 1029 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  37.25 
 
 		 1018 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  33.9 
 
 		 1029 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  33.98 
 
 		 1046 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  37.99 
 
 		 424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  37.75 
 
 		 1005 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  37.75 
 
 		 1020 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  36.48 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  34.81 
 
 		 1498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  36.16 
 
 		 1021 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  34.81 
 
 		 1010 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  38.82 
 
 		 388 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  35.42 
 
 		 1010 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  35.93 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  35.13 
 
 		 1024 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  36.9 
 
 		 908 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  38.68 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  36.67 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  38.34 
 
 		 407 aa  220  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  34.47 
 
 		 429 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  37.01 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  50 
 
 		 560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  36.46 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  36.24 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  37.77 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  37.77 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  38.54 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  37.43 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  36.13 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  36.07 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  35.17 
 
 		 402 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  36.43 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  35.36 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  34.88 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  34.38 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.81 
 
 		 402 aa  192  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  31.71 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  34.36 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  34.28 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  33.85 
 
 		 386 aa  183  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  34.54 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  34.58 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  33.94 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  31.78 
 
 		 384 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.86 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  33.95 
 
 		 396 aa  177  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  33.59 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  30.93 
 
 		 381 aa  163  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  29.62 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  29.62 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  29.43 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  29.81 
 
 		 373 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  29.81 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  29.64 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  29.62 
 
 		 376 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  29.62 
 
 		 376 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  29.62 
 
 		 376 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  29.33 
 
 		 376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  29.89 
 
 		 376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  29.33 
 
 		 376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  28.81 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  30.03 
 
 		 401 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  30.69 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  28.06 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  28.25 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  25.91 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  26.75 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  25.21 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  24.65 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  24.59 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  23.41 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3374  amidohydrolase  24.69 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  24.47 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  23.66 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  24.87 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  24.01 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  21.52 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  22.25 
 
 		 582 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2767  Urease  35.71 
 
 		 548 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.18111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  23.21 
 
 		 448 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03850  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 		 296 aa  53.9  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  44.78 
 
 		 666 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  44.12 
 
 		 1060 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  24.46 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  23.02 
 
 		 438 aa  53.9  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>