More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5828 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  81.99 
 
 
425 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  88.29 
 
 
424 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  100 
 
 
427 aa  865    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  62.23 
 
 
420 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  61.52 
 
 
420 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  34.45 
 
 
395 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  33.51 
 
 
395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  32.35 
 
 
379 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  30.57 
 
 
431 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  29.76 
 
 
425 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  27.75 
 
 
426 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  31.23 
 
 
427 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  30.6 
 
 
379 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  27.89 
 
 
403 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  25.99 
 
 
402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  28.88 
 
 
377 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  28.47 
 
 
370 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  31.68 
 
 
399 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  32.35 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  28.4 
 
 
377 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  28.64 
 
 
377 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  25.25 
 
 
402 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  28.64 
 
 
377 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  28.4 
 
 
377 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  28.64 
 
 
377 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  25.93 
 
 
404 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  29.38 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  29.07 
 
 
423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  28.33 
 
 
412 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  28.13 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  29.88 
 
 
377 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  29.16 
 
 
379 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  27.91 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  27.8 
 
 
378 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  28.64 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  24.94 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  24.94 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  24.94 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  24.94 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  24.94 
 
 
387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  25.33 
 
 
366 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  25.33 
 
 
366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  25.33 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  25.33 
 
 
366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  25.33 
 
 
366 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  25.07 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  25.07 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  25.07 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  24.27 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  24.8 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.81 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  40.43 
 
 
474 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  50.77 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  25.69 
 
 
497 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.44 
 
 
433 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.31 
 
 
433 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.31 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  25.65 
 
 
425 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  43.75 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  24.87 
 
 
470 aa  59.7  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  27.86 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  38.2 
 
 
584 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.15 
 
 
429 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  39.33 
 
 
418 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  48.39 
 
 
561 aa  56.6  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  39.33 
 
 
588 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  39.33 
 
 
588 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.39 
 
 
561 aa  56.6  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  39.33 
 
 
584 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  39.33 
 
 
584 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.5 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  39.56 
 
 
587 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  39.33 
 
 
700 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  36.23 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  43 
 
 
534 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.04 
 
 
494 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.62 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  41.67 
 
 
474 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  39.33 
 
 
699 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  24.76 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  50.75 
 
 
475 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  49.21 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  43.94 
 
 
445 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  34.38 
 
 
428 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  41.18 
 
 
483 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  35.48 
 
 
422 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  37.5 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  33.1 
 
 
503 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  43.75 
 
 
479 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  47.76 
 
 
467 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  43.75 
 
 
583 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  40 
 
 
481 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  43.55 
 
 
436 aa  53.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  27.25 
 
 
402 aa  53.1  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  34.33 
 
 
461 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.62 
 
 
500 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>