196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2767 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2610  urease  81.49 
 
 
562 aa  871    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2767  Urease  100 
 
 
548 aa  1095    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.18111  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1552  urease  48.75 
 
 
557 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1685  urease subunit alpha  46.83 
 
 
571 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0887  urease subunit alpha  45.02 
 
 
555 aa  456  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0882  urease subunit alpha  42.88 
 
 
567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.894453  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00889  urease subunit alpha  42.5 
 
 
567 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.471074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4222  urease subunit alpha  42.59 
 
 
588 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332546  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2065  urease, alpha subunit  42.78 
 
 
573 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000341068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1816  urease subunit alpha  40.97 
 
 
572 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4442  urease subunit alpha  45.31 
 
 
568 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508475  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0335  urease subunit alpha  40.95 
 
 
570 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1427  urease subunit alpha  42.98 
 
 
569 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2452  urease subunit alpha  43.43 
 
 
569 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0184  urease subunit alpha  43.31 
 
 
568 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.595106  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6189  urease subunit alpha  44.31 
 
 
570 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0698012  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2197  urease subunit alpha  43.33 
 
 
570 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0196529  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1136  urease subunit alpha  44.46 
 
 
570 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0415939  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1314  urease subunit alpha  42.51 
 
 
573 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1197  urease subunit alpha  44.31 
 
 
570 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770488  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5114  urease subunit alpha  42.21 
 
 
572 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_004310  BR1358  urease subunit alpha  42.33 
 
 
573 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2269  urease subunit alpha  42.08 
 
 
569 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159404  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1357  urease subunit alpha  44.31 
 
 
570 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209693  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1469  urease subunit alpha  41.87 
 
 
572 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2357  urease subunit alpha  41.75 
 
 
571 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6168  Urease  46.92 
 
 
549 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308489  normal  0.0462908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1307  urease subunit alpha  42.04 
 
 
572 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1962  urease subunit alpha  43.13 
 
 
569 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2314  urease subunit alpha  41.75 
 
 
571 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0270  urease subunit alpha  40.95 
 
 
570 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3618  urease subunit alpha  41.48 
 
 
568 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2211  urease subunit alpha  42.41 
 
 
575 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0100504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0956  urease subunit alpha  40.45 
 
 
568 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3694  urease subunit alpha  42.4 
 
 
568 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0835  urease subunit alpha  47.43 
 
 
559 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.893025  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0752  urease subunit alpha  41.45 
 
 
570 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2994  urease subunit alpha  40.39 
 
 
567 aa  428  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0975  urease subunit alpha  43.76 
 
 
571 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.432056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3939  urease subunit alpha  41.54 
 
 
583 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743234  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1076  urease subunit alpha  43.01 
 
 
575 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2011  urease subunit alpha  41.91 
 
 
570 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4049  urease subunit alpha  44.01 
 
 
571 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3051  urease subunit alpha  41.73 
 
 
570 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285031  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2032  urease subunit alpha  42.58 
 
 
572 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593875  normal  0.203128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2880  urease subunit alpha  41.8 
 
 
566 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3477  urease subunit alpha  41.55 
 
 
570 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0221  urease subunit alpha  41.58 
 
 
568 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.931329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3307  urease subunit alpha  41.37 
 
 
570 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1350  urease subunit alpha  41.46 
 
 
572 aa  425  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533774  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2305  urease subunit alpha  42 
 
 
570 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0687  urease subunit alpha  40.88 
 
 
570 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1182  urease subunit alpha  42.46 
 
 
567 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425858  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2993  urease subunit alpha  42.25 
 
 
567 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.386012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0974  urease subunit alpha  41.01 
 
 
572 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1861  urease subunit alpha  42.03 
 
 
572 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2771  urease subunit alpha  41.62 
 
 
569 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0399  urease subunit alpha  42.18 
 
 
575 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2184  urease subunit alpha  41.68 
 
 
572 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0928  urease subunit alpha  42.4 
 
 
568 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0790  urease subunit alpha  42.58 
 
 
568 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2383  urease subunit alpha  41.02 
 
 
570 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.219851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3204  urease, alpha subunit  43.03 
 
 
574 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00573416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4006  urease subunit alpha  42.23 
 
 
568 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  40.99 
 
 
878 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3016  urease subunit alpha  41.06 
 
 
570 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.290532  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0870  urease subunit alpha  42.4 
 
 
568 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4156  urease subunit alpha  42.36 
 
 
570 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.949712  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0421  urease subunit alpha  42.4 
 
 
568 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0779  urease subunit alpha  42.23 
 
 
568 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0900  urease subunit alpha  42.4 
 
 
568 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0667  urease subunit alpha  42.49 
 
 
575 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121579  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0988  urease subunit alpha  41.83 
 
 
568 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3504  urease, alpha subunit  44.13 
 
 
572 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2845  urease subunit alpha  42.16 
 
 
567 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0747373  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1871  urease subunit alpha  41.02 
 
 
571 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2864  urease subunit alpha  41.3 
 
 
575 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1055  urease subunit alpha  40.18 
 
 
569 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0995  urease subunit alpha  41.28 
 
 
571 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.69037  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3205  urease subunit alpha  41.24 
 
 
570 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6111  urease subunit alpha  41.48 
 
 
568 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3104  urease subunit alpha  42.23 
 
 
568 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1496  urease subunit alpha  42.15 
 
 
564 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2935  urease subunit alpha  41.99 
 
 
567 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.19721  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0961  urease subunit alpha  41.42 
 
 
572 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0385  urease subunit alpha  42 
 
 
570 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1027  urease subunit alpha  41.65 
 
 
569 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3242  urease subunit alpha  41.5 
 
 
575 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1704  urease, alpha subunit  41.62 
 
 
569 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1323  urease subunit alpha  41.86 
 
 
567 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1950  urease subunit alpha  41.48 
 
 
568 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324584  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1193  urease subunit alpha  40.77 
 
 
567 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.896541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2844  urease subunit alpha  42.16 
 
 
567 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.438037  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2184  urease subunit alpha  42.15 
 
 
568 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1241  urease subunit alpha  40.67 
 
 
568 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2490  urease subunit alpha  41.98 
 
 
568 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363365  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2417  urease subunit alpha  42.01 
 
 
567 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2684  urease subunit alpha  40.18 
 
 
570 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.726413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3556  urease subunit alpha  40.42 
 
 
572 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.895593  normal  0.0429262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0243  urease subunit alpha  40.35 
 
 
576 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>